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微衛(wèi)星分析STR/SSR
我公司通過(guò)熒光標(biāo)記的PCR引物擴(kuò)增微衛(wèi)星位點(diǎn)區(qū)域序列,采用ABI 3730XL Analyser同時(shí)對(duì)96個(gè)樣品的熒光PCR產(chǎn)物進(jìn)行毛細(xì)管電泳檢測(cè)。
服務(wù)類(lèi)別:測(cè)序/合成總訪問(wèn):1210
最后更新:2021-9-1半年訪問(wèn):1
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服務(wù)商: 北京億鳴復(fù)興生物科技有限公司 查看該公司所有服務(wù) >>
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★服務(wù)描述:
微衛(wèi)星標(biāo)記(microsatellite),又稱(chēng)為短串聯(lián)重復(fù)序列(simple tandem repeats, STRs),是均勻分布于真核生物基因組中的簡(jiǎn)單重復(fù)序列,由2~6個(gè)核苷酸的串聯(lián)重復(fù)片段構(gòu)成,由于重復(fù)單位的重復(fù)次數(shù)在個(gè)體間呈高度變異性并且數(shù)量豐富,因此微衛(wèi)星標(biāo)記的應(yīng)用非常廣泛。
微衛(wèi)星位點(diǎn)通常通過(guò)PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物通過(guò)電泳分析并根據(jù)大小分離等位基因進(jìn)行檢測(cè)。PCR擴(kuò)增后的等位微衛(wèi)星可以用多種方法檢測(cè),如熒光染色標(biāo)記、銀染或熒光染色(如EB)。微衛(wèi)星存在于大多數(shù)生物的基因組,它們?cè)诨蚪M里均勻分布,所以被廣泛得應(yīng)用于遺傳雜交育種和繪制染色體遺傳圖譜的標(biāo)記物。高度多態(tài)的微衛(wèi)星,可以用來(lái)在人群進(jìn)行個(gè)體識(shí)別。


★服務(wù)內(nèi)容:
我們提供客戶PCR產(chǎn)物掃描及數(shù)據(jù)分析,針對(duì)客戶特定的樣本設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)方案,包括熒光標(biāo)記的選擇,引物的設(shè)計(jì)、合成和標(biāo)記,熒光分子量 Marker 的選用等,并完成特定樣本的STR分型服務(wù)。


★服務(wù)流程:
前期確認(rèn)階段:實(shí)驗(yàn)樣本類(lèi)型,數(shù)量,引物,簽訂實(shí)驗(yàn)合作合同;
實(shí)驗(yàn)階段:DNA提取,PCR擴(kuò)增,瓊脂糖電泳檢測(cè),PAGE篩選批量擴(kuò)增引物和可以進(jìn)行混合檢測(cè)的引物,批量PCR, ABI3700xl批量檢測(cè)(內(nèi)標(biāo)為ROX500,Liz-500);
數(shù)據(jù)分析:和客戶詳細(xì)溝通,確認(rèn)分析方案。品種分析,或群體分析。讀取01矩陣or片段大小:聚類(lèi)分析;多樣性分析;多態(tài)位點(diǎn)數(shù)(AP)、多態(tài)位點(diǎn)百分率(P)、平均等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Nei's基因多樣性指數(shù)(H)、Shannon's信息指數(shù)(I)、遺傳分化度(Gst)等,利用NTSYS進(jìn)行聚類(lèi)分析。


★需要提供的信息:
新鮮植物組織(最好是黃化苗組織)或動(dòng)物血液、組織材料,采樣后立即放入液氮中速凍。
基因組DNA:要求完整,純度高,無(wú)RNA污染,總量大于 50 μg。
提供已知的全長(zhǎng)基因序列,GeneBank ID,詳細(xì)背景資料,DNA/RNA來(lái)源、豐度等。


★服務(wù)周期:
根據(jù)樣品數(shù)量來(lái)協(xié)商,一般在20到30個(gè)工作日。


★服務(wù)說(shuō)明:
1)我們抽取每對(duì)引物擴(kuò)增樣品的10%進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn)以確定基因掃描上樣量,如果客戶樣品擴(kuò)增效率低或擴(kuò)增效率不一致導(dǎo)致某些樣品未檢出信號(hào),我公司仍收取檢測(cè)費(fèi)用。
2)為了保證實(shí)驗(yàn)進(jìn)度,本公司采用批量上樣的方法,如果預(yù)檢測(cè)未發(fā)現(xiàn)異常,而實(shí)際檢測(cè)后發(fā)現(xiàn)異常(如大量樣本未擴(kuò)出或擴(kuò)增效率低等情況),我們會(huì)及時(shí)通知客戶,由客戶決定是否繼續(xù)檢測(cè),之前產(chǎn)生的檢測(cè)費(fèi)用由客戶承擔(dān)。
3)根據(jù)客戶提供的信息,分析軟件自動(dòng)判讀結(jié)果。為保證結(jié)果的客觀性,工作人員僅手動(dòng)去掉Pull up峰,染料峰。如客戶要求工作人員進(jìn)行人工判別,工作人員可以據(jù)經(jīng)驗(yàn)向客戶提出意見(jiàn),此意見(jiàn)僅供參考,公司不為此承擔(dān)任何責(zé)任。
4)客戶提供基因組DNA樣品時(shí),應(yīng)保證樣品的密封性。如需樣品返還請(qǐng)?zhí)崆罢f(shuō)明,如無(wú)特殊說(shuō)明,一個(gè)月后本公司將處理掉樣本,如客戶提前未說(shuō)明返還導(dǎo)致樣品丟失本公司不負(fù)責(zé)任。
5)對(duì)客戶的實(shí)驗(yàn)結(jié)果本公司保留30天,客戶如有問(wèn)題請(qǐng)?jiān)?0天內(nèi)提出,30天后將刪除試驗(yàn)結(jié)果。


★其他服務(wù)項(xiàng)目:



★項(xiàng)目一般流程:


聯(lián)系人:向經(jīng)理
電話:18611436926
QQ:1934850071
地址:北京市海淀區(qū)學(xué)院路35號(hào)院世寧大廈14層1405室

 

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