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microRNA(miRNA)測序服務(wù)

microRNA(miRNA)測序服務(wù)


microRNA(miRNA) Sequencing Service
康成生物以Illumina Genome Analyzer IIx為技術(shù)平臺,提供microRNA測序服務(wù)。高通量測序技術(shù)具備數(shù)字化信號、任意物種的高通量分析、高靈敏度、高質(zhì)量數(shù)據(jù)、高置信度等優(yōu)勢。
服務(wù)類別:測序/合成總訪問:4345
最后更新:2018-11-26半年訪問:3
參考報價:免費咨詢800-820-5058;400-886-5058
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microRNA測序服務(wù)

     microRNA是一類大小為21-23nt的非編碼小RNA分子,通過沉默或降解其靶點mRNA分子調(diào)控基因表達。大量研究表明,microRNA在正常發(fā)育過程以及疾病發(fā)生過程中具有重要的作用,在診斷和治療領(lǐng)域具有光明的應(yīng)用前景。然而目前研究microRNA的方法主要是通過實時定量PCR以及基因芯片技術(shù),這些方法主要關(guān)注microRNA的表達與定量,并僅局限于研究那些序列信息或二級莖環(huán)結(jié)構(gòu)信息已知的microRNA,無法尋找和發(fā)現(xiàn)新的microRNA分子。
     基于Illumina高通量測序平臺的microRNA測序技術(shù)突破了目前研究技術(shù)手段上的局限性,不但可以檢測microRNA表達差異,而且可以研究microRNA的3’異質(zhì)性,眾多的isomiR(microRNA異構(gòu)體),以及未發(fā)現(xiàn)的新的microRNA,為更加靈活、深入研究microRNA提供解決方案。

 

康成生物為您提供microRNA測序技術(shù)服務(wù),您只需要提供保存完好的組織或細胞標本,康成的技術(shù)服務(wù)人員就可為您完成全部實驗操作,包括RNA抽提、小RNA文庫構(gòu)建和純化、高通量測序和數(shù)據(jù)分析、并提供完整的實驗報告。

 

microRNA測序技術(shù)優(yōu)勢
* 適用于所有物種的microRNA表達譜分析——無需預(yù)知microRNA的序列和二級結(jié)構(gòu)信息
全基因組范圍的表達譜分析——涵蓋了任意長度的,已知和未知的microRNA
數(shù)字化信號——測序直接獲得序列,可鑒別序列間單個堿基的差異,識別microRNA變體;
檢測范圍寬——跨越5個數(shù)量級的寬檢測閾值,從幾個到數(shù)十萬個拷貝精確計數(shù);
靈敏度高——每個獨立的測序通道可以檢測多達1000萬轉(zhuǎn)錄組分子序列,提供了極大的數(shù)據(jù)深度與覆蓋率,能夠檢測豐度極低的,以及稀少的microRNA。
數(shù)據(jù)質(zhì)量高——microRNA測序具有極大的測序通量,靈敏度與精確性,同時其產(chǎn)生的定量數(shù)據(jù)與實時定量PCR結(jié)果具有很高的一致性。
生物信息分析更豐富——能夠隨時使用最新的microRNA數(shù)據(jù)庫注釋原始數(shù)據(jù)中已知的microRNA,還能夠進一步發(fā)掘未匹配數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)新的microRNA種類及異構(gòu)體,尋找更深入的研究信息。

 

 

康成生物microRNA測序的特點

1. 一站式解決方案

康成生物獨家為您提供microRNA高通量測序全程技術(shù)服務(wù),您只需要提供保存完好的組織或細胞樣本,康成的測序技術(shù)服務(wù)人員就可為您完成全部實驗操作,并提供完整的實驗報告。

2.  適合樣品量少的客戶

康成對測序?qū)嶒灲?jīng)過優(yōu)化,從總RNA開始實驗,不需要對MicroRNA進行富集和反復(fù)的純化,因此對于樣品量少的客戶更加適合, 1ug就可以進行實驗。

3.  節(jié)省實驗的步驟,減少實驗誤差

傳統(tǒng)方法是先對microRNA進行富集,再兩邊加接頭,而且每一步都要純化回收,很容易產(chǎn)生實驗誤差,而我們只需要對總RNA就能完成實驗,減少實驗誤差。
4. 深入的數(shù)據(jù)分析

康成生物擁有強大的生物信息學(xué)團隊,能夠根據(jù)不同客戶的要求進行標準和深入的數(shù)據(jù)分析,提供能直接用于文章發(fā)表的圖表和數(shù)據(jù)。

 

康成生物提供的microRNA測序服務(wù)流程


1. 樣品RNA準備
2. 測序文庫構(gòu)建

   PAGE膠純化特定大小的microRNA分子
    連接5’RNA接頭
    連接3’RNA接頭
    逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)獲得cDNA測序文庫
    高保真聚合酶擴增構(gòu)建的測序文庫
3. DNA成簇(Cluster)擴增
4. 高通量測序(Illumina Genome Analyzer IIx)
5. 數(shù)據(jù)分析

    原始數(shù)據(jù)讀取
    使用公用microRNA數(shù)據(jù)庫注釋已知microRNA
    深層次數(shù)據(jù)分析
6. 提供實驗報告
    原始數(shù)據(jù)報告(Fasta-Q格式),包含所有測序序列信息,堿基讀取質(zhì)量評估
    基本數(shù)據(jù)分析報告(Excel表格),包含有效序列的序列信息、與參考基因組比對后的注釋信息等
    高級數(shù)據(jù)分析(應(yīng)客戶要求定制),如使用已知數(shù)據(jù)庫注釋已知microRNA及分析不同樣本間表達水平差異,使用已知數(shù)據(jù)庫鑒別rRNA,tRNA,snRNA,snoRNA并預(yù)測新的microRNA,預(yù)測microRNA的靶點基因。

 

 

 

 

 

上海康成生物工程有限公司
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