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GeoMx DSP技術助力下咽鱗狀細胞癌的腫瘤微環境研究

瀏覽次數:852 發布日期:2025-1-14  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
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文章題目:空間轉錄組學揭示下咽鱗狀細胞癌的腫瘤微環境及SLCO2A1與腫瘤抑制的相關性


1 文章概況 

下咽鱗狀細胞癌(HSCC)是一種具有惡性特征和較差預后的頭頸部腫瘤。該項研究利用DSP技術首次對HSCC進行了空間轉錄組學分析。研究樣本包括來自四位患者的原位腫瘤組織、腫瘤周圍組織及淋巴轉移組織。通過分析所有ROI超過18,000個基因的表達,發現腫瘤組織中的成纖維細胞可能參與腫瘤的發生發展,淋巴轉移組織的免疫浸潤低于原位腫瘤。研究還揭示了與預后相關的基因表達差異,例如SLCO2A1在腫瘤和淋巴轉移組織中顯著下調,并與免疫浸潤相關,且其過表達可抑制Fadu細胞的增殖和轉移,表明SLCO2A1可能是HSCC的腫瘤抑制基因,可作為診斷和治療的潛在靶點
 
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技術路線

空間轉錄組技術 

形態學標記:PanCK(上皮細胞)、CD45(免疫細胞)、αSMA(成纖維細胞)和SYTO 13(核染色)。Panel:GeoMx® Whole Transcriptome Atlas
 
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DSP技術:下咽癌、鄰近正常組織和淋巴轉移組織的空間分布圖

3 樣本信息 

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4 文章結論 


通過DSP技術分析4例HSCC患者的正常、腫瘤和淋巴組織中的上皮細胞、成纖維細胞和免疫細胞的基因表達差異,揭示了與腫瘤發生和免疫微環境相關的關鍵基因變化。研究發現,在腫瘤組織中,與正常組織相比,SLCO2A1在腫瘤上皮細胞和成纖維細胞中表達下調,而該基因在頭頸鱗狀細胞癌(HNSCC)中與良好預后有關。此外,MPPED2在淋巴轉移組織的上皮細胞中上調,而IGHM和FCRL2在淋巴轉移組織的免疫細胞中也顯示上調。功能富集和免疫浸潤分析進一步支持了這些基因的功能特性。研究還通過qRT-PCR、免疫組化染色及基因表達生存分析驗證了SLCO2A1在HSCC中的抑癌作用,表明其能夠抑制HSCC的增殖和轉移,并且與HNSCC中的免疫浸潤呈正相關。因此,文章得出SLCO2A1可能是HSCC的一種潛在抗癌靶點和良好的預后標志物,提供了未來診斷和治療的新方向。

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主要結論圖

發布者:上海生物芯片有限公司
聯系電話:400-100-2131
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