為什么男性更容易患腎癌?為什么一些腎病在女性中更易緩解?這些性別差異,可能早在我們基因中寫好了程序。最近發表在 Nature Genetics (IF:31.7)的一項研究《小鼠腎臟的多組學與空間分析揭示了貫穿生命周期的性別特異性基因調控差異》,從發育到衰老,對68只不同性別、不同年齡段的小鼠腎臟做了全生命周期的多組學空間轉錄組分析,構建了一個“時間--空間--性別”的分子地圖。
01 文章背景
腎臟是維持體液平衡、調控血壓和電解質穩態的重要器官,腎癌、慢性腎病、急性腎損傷等眾多腎臟疾病表現出顯著的性別差異。盡管已有研究在特定時間點發現腎臟不同腎單位中存在性別差異表達,但對其在整個生命周期中的動態變化、以及空間分布特征尚缺乏系統認知。本研究由美國華盛頓大學團隊牽頭,構建了覆蓋六個時間點、雙性別以及多組學維度的小鼠腎臟多組學整合圖譜,揭示了近曲小管(PT)為主要的性別調控熱點區域,并發現了多個偏性別表達的轉錄調控模塊和空間表達模式。
02 空間技術平臺與樣本采集
1. 本研究整合了六種組學平臺技術:
snRNA-seq:單核轉錄組測定
snATAC-seq:單核染色質開放性測序
10X Visium :空間轉錄組
Xenium:單細胞空間原位雜交
IF:多重免疫熒光
Pheno Cycler:多重蛋白染色
2. 樣本采集:
使用 C57BL/6J小鼠,雌雄各半,共68只。覆蓋六個關鍵發育與衰老時間點:胚胎期(E16.5)、新生期(P0)、青少年(W3)、成年(W12、W52)、老年(W92)。共獲得76份腎臟樣本,構建“時間—性別—空間”的三維多組學分析矩陣。