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SWATH定量蛋白組學的基本原理和特點

瀏覽次數:807 發布日期:2024-2-25  來源:百泰派克生物科技

"SWATH" 是 "Sequential Window Acquisition of all Theoretical Mass Spectra" 的縮寫,它是一種質譜技術,常用于蛋白質組學定量分析。今天小編就帶大家一起了解一下 SWATH 定量蛋白組學的基本原理和特點:

圖1. SWATH定量蛋白組學服務技術平臺

1、基本原理:

 

在 SWATH 分析中,質譜儀連續地和自動地掃描一系列質量窗口,覆蓋所有潛在的前體離子。這樣,理論上所有可能的離子都會被檢測到。與定性的數據依賴掃描 (DDA) 相比,SWATH 為數據獨立掃描 (DIA) 提供了更加系統的、無偏的數據收集方式。

2、定量特點:

 

SWATH 的特點是它可以在復雜樣本中進行多成分的高通量、高重復性和高精度的定量分析。這使得它特別適合于那些需要大規模樣本隊列比較的研究,例如生物標志物發現。

3、數據處理:

 

由于 SWATH 收集的數據是非常復雜的,它通常需要特定的軟件和算法進行數據提取和定量。這些軟件會使用預先獲取的蛋白質/肽段的質譜圖庫來輔助識別和定量。

4、應用領域:

 

SWATH 質譜技術在各種生物研究中都有應用,包括生物標志物鑒定、通路分析、蛋白質-蛋白質相互作用研究等。

5、與其他技術的比較:

與傳統的數據依賴掃描 (DDA) 技術相比,SWATH 提供了更好的定量重復性和更廣的動態范圍。但由于其數據復雜性,數據分析可能會更加具有挑戰性。

發布者:北京百泰派克生物科技有限公司
聯系電話:010-67869385
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