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精準(zhǔn)定量與多樣樣本:iTRAQ在蛋白質(zhì)組學(xué)中的優(yōu)缺點

瀏覽次數(shù):169 發(fā)布日期:2024-1-13  來源:百泰派克生物科技

一、引言:蛋白質(zhì)組學(xué)與iTRAQ的關(guān)聯(lián)

 

蛋白質(zhì)組學(xué)是一種研究所有蛋白質(zhì)表達、修飾、互作、功能以及網(wǎng)絡(luò)等整體性問題的新興學(xué)科。在此學(xué)科中,蛋白質(zhì)的定量分析被認為是最重要的技術(shù)之一。其中,iTRAQ(同位素標(biāo)記的相對和絕對定量)技術(shù)在蛋白質(zhì)組學(xué)定量中得到了廣泛應(yīng)用。該技術(shù)的主要優(yōu)點在于其靈活性和擴展性,但也存在一些潛在的缺點。通過分析其優(yōu)缺點,我們可以更好地改進這一技術(shù),為藥物研發(fā)提供更準(zhǔn)確、更可靠的數(shù)據(jù)。

二、優(yōu)點:精準(zhǔn)定量與多樣樣本

 

2.1 精確性

 

iTRAQ涵蓋了既定的質(zhì)譜數(shù)值,它憑借同位素標(biāo)記的優(yōu)點成果低至一百分之一的偏差,保證了其定量結(jié)果的精確性與對比性。

2.2 多樣樣本處理

 

iTRAQ提供了讓研究者同時處理多個樣本的可能性。比如,iTRAQ8plex可以同時處理8個不同樣品,極大地提高了樣本處理的效率。

二.缺點:溶解性和蛋白質(zhì)覆蓋率

 

2.1 溶解性問題

 

盡管iTRAQ的使用在一定程度上解決了樣本溶解性差的問題,但樣品制備過程中存在溶解性差異的問題仍然嚴(yán)重影響了iTRAQ標(biāo)記效率,從而影響了測定的結(jié)果。

2.2 蛋白質(zhì)覆蓋率

 

盡管iTRAQ應(yīng)用廣泛,但它的覆蓋率往往受限于某些不易離子化或不易被酶切的蛋白質(zhì),這使得很多重要的疾病相關(guān)蛋白質(zhì)無法被準(zhǔn)確定量。

三.結(jié)論:研究目標(biāo)與技術(shù)改進

 

無論是在基礎(chǔ)科學(xué)研究,還是在臨床醫(yī)學(xué)和藥物研發(fā)中,我們都無法忽視蛋白質(zhì)的定量分析。盡管iTRAQ具有其獨特的優(yōu)點和一些可以改進的缺點,但其在蛋白質(zhì)組學(xué)中的應(yīng)用仍具有很大的潛力。因此,我們的研究目標(biāo)應(yīng)是在提高iTRAQ的準(zhǔn)確性、樣本適應(yīng)性、蛋白質(zhì)覆蓋率等方面持續(xù)尋求突破和改進。通過探索,實現(xiàn)更精細、更寬廣的蛋白質(zhì)定量分析,更好地滿足未來生物醫(yī)學(xué)研究的需求。

圖1

發(fā)布者:北京百泰派克生物科技有限公司
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