為什么男性更容易患腎癌？為什么一些腎病在女性中更易緩解？這些性別差異，可能早在我們基因中寫好了程序。最近發(fā)表在 Nature Genetics （IF：31.7）的一項(xiàng)研究《小鼠腎臟的多組學(xué)與空間分析揭示了貫穿生命周期的性別特異性基因調(diào)控差異》，從發(fā)育到衰老，對(duì)68只不同性別、不同年齡段的小鼠腎臟做了全生命周期的多組學(xué)空間轉(zhuǎn)錄組分析，構(gòu)建了一個(gè)“時(shí)間--空間--性別”的分子地圖。

01 文章背景

腎臟是維持體液平衡、調(diào)控血壓和電解質(zhì)穩(wěn)態(tài)的重要器官，腎癌、慢性腎病、急性腎損傷等眾多腎臟疾病表現(xiàn)出顯著的性別差異。盡管已有研究在特定時(shí)間點(diǎn)發(fā)現(xiàn)腎臟不同腎單位中存在性別差異表達(dá)，但對(duì)其在整個(gè)生命周期中的動(dòng)態(tài)變化、以及空間分布特征尚缺乏系統(tǒng)認(rèn)知。本研究由美國(guó)華盛頓大學(xué)團(tuán)隊(duì)牽頭，構(gòu)建了覆蓋六個(gè)時(shí)間點(diǎn)、雙性別以及多組學(xué)維度的小鼠腎臟多組學(xué)整合圖譜，揭示了近曲小管（PT）為主要的性別調(diào)控?zé)狳c(diǎn)區(qū)域，并發(fā)現(xiàn)了多個(gè)偏性別表達(dá)的轉(zhuǎn)錄調(diào)控模塊和空間表達(dá)模式。

02 空間技術(shù)平臺(tái)與樣本采集

1. 本研究整合了六種組學(xué)平臺(tái)技術(shù)：

snRNA-seq：?jiǎn)魏宿D(zhuǎn)錄組測(cè)定
snATAC-seq：?jiǎn)魏巳旧�質(zhì)開放性測(cè)序
10X Visium ：空間轉(zhuǎn)錄組
Xenium：?jiǎn)渭?xì)胞空間原位雜交
IF:多重免疫熒光
Pheno Cycler：多重蛋白染色

2. 樣本采集：

使用 C57BL/6J小鼠，雌雄各半，共68只。覆蓋六個(gè)關(guān)鍵發(fā)育與衰老時(shí)間點(diǎn)：胚胎期（E16.5）、新生期（P0）、青少年（W3）、成年（W12、W52）、老年（W92）。共獲得76份腎臟樣本，構(gòu)建“時(shí)間—性別—空間”的三維多組學(xué)分析矩陣。