免疫共沉淀（Co- Immunoprecipitation, Co-IP）是利用抗原和抗體的特異性結合以及細菌的Protein A或G特異性地結合到免疫球蛋白的Fc片段的現象開發出來的方法。其基本原理是，在細胞裂解液中加入抗興趣蛋白的抗體，孵育后再加入與抗體特異結合的結合 于Agarose珠上的Protein A或G，若細胞中有與興趣蛋白結合的目的蛋白，就可以形成這樣一種復合物：“目的蛋白—興趣蛋白—抗興趣蛋白抗體—Protein A或G”，經變性聚丙烯酰胺凝膠電泳，復合物又被分開。然后經免疫印跡或質譜檢測目的蛋白。這種方法得到的目的蛋白是在細胞內與興趣蛋白天然結合的，符合 體內實際情況，得到的結果可信度高。

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