AAV血清型多種多樣，不同血清型轉染的組織類型、細胞類型和感染效率各不相同。其中，多種AAV血清型可不同程度地誘導目的基因在肺部的表達，比如AAV2、AAV5、AAV6及AAV9等。其中，AAV6由于可以有效地介導基因在氣道和肺泡II型細胞的表達，而氣道和肺泡II型細胞通常是肺部疾病基因治療的靶細胞群體，因此被認為是用于肺部基因轉移的一種理想AAV血清型。
下圖所列為AAV2、AAV5、AAV6及AAV9四種血清型對肺部的感染情況：

研究表明，針對肺部感染rAAV在血清型上的選擇根據動物模型的不同而存在差異，主要體現在小鼠及較低等靈長類動物與高等靈長類動物之間。在小鼠及一些較低等的靈長類動物中，AAV5及AAV6是感染肺部的理想選擇；針對高等靈長類動物，AAV1對肺部的感染效率更高；在肺癌的研究中，我們通常推薦AAV2血清型。
種類AAV血清型推薦小鼠與低等靈長類動物肺部AAV5/AAV6高等靈長類動物肺部AAV1肺癌AAV2
2020年牛津大學Helena Meyer-Berg等研究者通過建立肺芽樣器官( lung bud organoids，LBOs)模型——一種由人胚胎干細胞(hESCs)生成的人肺實質模型，用于篩選病毒載體轉導，進而確定適合于人肺實質轉導的血清型。研究證實在所用的八種AAV血清型中，rAAV2和rAAV6以及rAAV6變體（rAAV6.2和rAAV6.2FF），對人肺實質親和性較強。