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第二代 HIV-INSTI 的作用方式

瀏覽次數:812 發布日期:2021-8-30  來源:MedChemExpress
研究人員利用單粒子低溫電子顯微鏡在近原子分辨率下觀察了最新 HIV 整合酶鏈轉移酶抑制劑 (INSTI) Dolutegravir (DTG) 和 Bictegravir (BIC) 的作用方式。整合酶中 Q148H/G140S 氨基酸取代使 INSTI 臨床失效,擾亂了酶活性位點的鎂離子最佳配位。二代化合物化學支架介導的與蛋白質骨架的相互作用,對拮抗包含 Q148H 和 G140S 突變的病毒至關重要。該研究結果揭示了與鎂離子的結合是 INSTI 藥效團的一個基本弱點,被病毒利用以產生抗藥性,并為開發此類抗 HIV/AIDS 治療藥物提供了結構框架。

已知逆轉錄病毒通過將其已被反轉錄為 DNA 的 RNA 的拷貝,插入宿主基因組進行復制。該過程形成整合體 (intasome),一種核蛋白復合物,包含結合在病毒 DNA 末端的病毒整合酶的拷貝。INSTI 通過抑制病毒整合酶阻止 HIV 復制,并已廣泛用于 HIV 治療。

圖 1. SIVrcm 整合體核心的重建
研究團隊通過評估與循環中 HIV-1 病毒株高度相關的靈長類慢病毒整合酶 (IN) 蛋白 SIVrcm (白頸白眉猴感染的SIVs),建立適用于 INSTI 開發的實驗系統。實驗中,SIVrcm IN 核蛋白復合物表現出鏈轉移活性并且對 INSTI 抑制劑敏感,第一代 (Raltegravir, RAL) 和第二代 (Dolutegravir Bictegravir,購自 MedChemExpress) INSTI 在相似的半最大有效濃度下 (EC50) 抑制 HIV-1 和 SIVrcm。在 SIVrcm 重組病毒中,IN Q148H/G140S 突變使 HIV-1 和 SIVrcm 對 RAL 的抵抗力顯著增加 (2000 以上),第二代 INSTI BIC 和 DTG 抗 HIV-1 和 SIVrcm 的 EC50 值分別升高約 5~8 倍和 40~73 倍。

 

圖 2. IN 活性位點中第二代 INSTI 的結合模式

通過 BIC 與 Q148H/G140S 突變的 SIVrcm 整合體的結合成像和精確模型中 ,氨基酸變化導致結合藥物位置發生移位,氫鍵需要在 Glu152 和 His148 側鏈中重新定位,這與 Mg2+ 離子的配位和藥物結合不相容,解釋了HIV 對 INSTI 的抗性機制。由 INSTI 活性結合位點獲得截斷的抑制劑類似物 1(analog1),評估其抗 HIV Q148H/G140S 的能力,發現氨基酸的取代增高了 DTG 與 HIV-1 整合體的解離速率,且對截短衍生物的影響更大,這表明與結合 IN β4-α2 連接器是第二代 INSTI 的關鍵特征。

圖 3. Q148H/G140S 取代對 DTG 和類似物 1 活性的影響
這篇文章可視化 INSTI 作用結構,揭示了突變如何引起活性位點的細微變化,從而影響藥物結合,或能更好地指導抗 HIV 藥物的開發。

原文鏈接:Cook NJ, et al. Structural basis of second-generation HIV integrase inhibitor action and viral resistance. Science. 2020 Feb 14;367(6479):806-810.

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發布者:上海皓元生物醫藥科技有限公司
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標簽: 整合酶 HIV
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