ArrayJet生物芯片點樣儀助力慢性淋巴細胞白血病的蛋白標志物篩選
瀏覽次數(shù):370 發(fā)布日期:2025-6-12
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慢性B淋巴細胞白血病(B-CLL)是最常見的血液癌癥,具有高度的基因組異質(zhì)性,目前研究多集中在基因組和轉(zhuǎn)錄組水平,對蛋白質(zhì)組,尤其是蛋白磷酸化修飾的功能及影響了解甚微。蛋白磷酸化是調(diào)控細胞信號的翻譯后關(guān)鍵修飾,與 CLL 的信號通路密切相關(guān),如 B 細胞抗原受體(BCR)的 tonic 信號傳導(dǎo)(低水平持續(xù)激活)在 CLL 發(fā)展中起關(guān)鍵作用,涉及 LYN、SYK 等酪氨酸激酶。現(xiàn)有治療如 BTK 抑制劑(伊布替尼)和 BCL-2 抑制劑(維奈托克)雖有效,但存在耐藥性和自身微環(huán)境影響等問題,且缺乏早期診斷和個性化治療的生物標志物。整合蛋白質(zhì)芯片和質(zhì)譜等高通量篩選技術(shù)為分析蛋白質(zhì)組的磷酸化提供了可能。
文章題目為“Tonic signaling of the B-cell antigen-specific receptor is a common functional hallmark in chronic lymphocytic leukemia cell phosphoproteomes at early disease stages”于2025年3月發(fā)表在Molecular Oncology雜志,作者來自于西班牙薩拉曼卡大學腫瘤研究中心。
在本研究中,19 例CLL樣患者(18 例 B-CLL 和 1 例 CLL )為研究對象。首先采集外周血(PB),流式細胞儀純化 CD19?、CD5?的腫瘤 B 細胞,純度 > 98%,凍存于液氮中備用。隨后使用含尿素的裂解緩沖液(尿素、磷酸酶抑制劑等)裂解細胞,超聲處理后離心收集上清液,并測定蛋白濃度。通過磷酸酪氨酸抗體免疫親和法富集磷酸肽,使用質(zhì)譜儀分析總蛋白和磷酸化肽段。蛋白組分析檢測到 13,504 個獨特肽段,對應(yīng) 2,970 個蛋白質(zhì),其中 28 個為新發(fā)現(xiàn)蛋白;蛋白磷酸化分析鑒定到 594 個磷酸肽段,對應(yīng) 316 個磷酸化蛋白,包括 55 個新發(fā)現(xiàn)磷酸肽段。英國ArrayJet生物芯片點樣儀制備蛋白質(zhì)芯片,檢測磷酸化蛋白表達。將 208 種抗體(靶向 162 種蛋白)點印在氨基修飾的玻片上,隨后孵育生物素標記的蛋白以及Cy5標記的鏈霉親和素, 雜交后使用熒光芯片掃描儀進行熒光信號分析。

圖1:實驗流程,從蛋白質(zhì)組學和磷酸化蛋白質(zhì)組學分析到親和蛋白質(zhì)組學(蛋白質(zhì)微陣列)和WB驗證。B-CLL: b細胞慢性淋巴細胞白血病;CLL:慢性淋巴細胞白血病;ESI-HCD:高能碰撞解離的電噴霧電離;(ESI)LC-MS /MS:液相色譜串聯(lián)質(zhì)譜;MBL:單克隆b細胞淋巴細胞增多癥;PTM:翻譯后修飾;WB,:western blot。
研究發(fā)現(xiàn)在2160個共表達蛋白中,有10%(220 個)發(fā)生了磷酸化,其主要參與 B 細胞激活和信號轉(zhuǎn)導(dǎo);BCR的 tonic 信號傳導(dǎo)和 NF-κB/STAT3 通路是 CLL 和 MBL 磷酸化組的共同特征。55 個新磷酸肽的發(fā)現(xiàn)擴展了 CLL 磷酸化組數(shù)據(jù)庫,為機制研究提供了可能的潛在靶點,并發(fā)現(xiàn)9 個磷酸化蛋白(如 BTK、SYK)與早期疾病階段高度相關(guān),可用于預(yù)后評估和治療監(jiān)測。整合多組學技術(shù)(質(zhì)譜、蛋白質(zhì)篩選芯片),提供了CLL蛋白質(zhì)組和磷酸化組的全景圖譜,為理解疾病異質(zhì)性、開發(fā)新型生物標志物奠定了基礎(chǔ)。
原文鏈接:https://febs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/1878-0261.70032
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