九叔归来3魁蛊婴在线观看_男人躁女人到高潮AV_香港成人论坛_亚洲精品久久久久久偷窥_夜来香成人网_亚洲制服 视频在线观看_无毒黄站_国产传媒18精品A片一区_麻花豆传媒剧国产MV在线观看_东北60岁熟女露脸在线_国产高清视频在线观看97_一道本视频一二三区_yellow免费播放在线观看_浪漫樱花动漫在线观看官网_高清AV熟女一区_天堂在线www_亚洲第一成年人网站_黄色在线免费观看_av女优快播_久久精品99国产精品日本

English | 中文版 | 手機版 企業登錄 | 個人登錄 | 郵件訂閱
當前位置 > 首頁 > 技術文章 > qPCR 和 Crystal dPCR 進行復雜生物樣本 DNA/RNA 絕對定量的比較

qPCR 和 Crystal dPCR 進行復雜生物樣本 DNA/RNA 絕對定量的比較

瀏覽次數:9909 發布日期:2018-9-17  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

復雜生物樣本(含PCR抑制劑)中DNA/RNA絕對定量的解決方案: Crystal dPCR更耐受抑制劑

dPCR和qPCR(Real-time PCR)技術定量檢測DNA/RNA時抑制劑的影響對比

眾所周知,數以千種的化學物質會抑制PCR反應有作用,而生物樣本往往都會含有類似的化合物,在DNA/RNA純化時,這類化合物很難去除,所以會存在DNA/RNA樣本中。

 

> qPCR和Crystal dPCR進行DNA/RNA定量的比較

qPCR (Real-time PCR)進行DNA/RNA定量時,基于Ct值,且依賴于分析的樣品和標準品之間的標準曲線,通過未知樣品與含有已知量核酸標準品之間的Ct值得到未知樣品的濃度。但當樣品中存在抑制劑時,標準品和樣品之間由于背景不同,所以PCR反應效率可能不同,因此定量結果將會有偏差(圖1A)。

Naica crystal dPCR進行DNA/RNA定量時,結果判讀在于通過熒光值區分微滴的陽性或陰性。即使有因抑制劑存在而導致PCR反應效率降低,仍然可以實現準確定量(圖1B)。

 

圖1.腐殖酸在qPCR(A)和Crystal dPCR(B)系統分析中的影響比較

 

在qPCR和Crystal dPCR平臺檢測中PCR反應均包含1X PerfeCta Multiplex qPCR Tough-mix,100 nM熒光素,500 nM ALB基因正向和反向引物,250 nM Cy5標記TaqMan探針和5.4 ng / uL人類基因組DNA。分別摻入0, 50和100ug / mL的腐殖酸。

 

還有很重要的一點我們需要注意,抑制劑對于同一DNA/RNA樣品中不同靶標基因絕對定量的影響也可能不同(圖2)。Naica Crystal dPCR系統有3個熒光通道,檢測您感興趣的基因上不同區域或基因組上不同的靶標基因,以檢查這種偏差。

 

圖2.腐殖酸的存在對于Crystal dPCR中對不同靶標的影響檢測

 

多重Crystal dPCR反應中含有PerfeCta Multiplex qPCR Toughmix,ALB基因的引物和探針(Cy-5標記),EGFR基因的引物和探針(HEX標記)和BRAF的引物和探針(FAM標記),并且使用相同量的人類基因組DNA摻入不同濃度的腐殖酸(利用Sigmoid即S型函數擬合)。以不添加抑制劑的DNA定量為0%抑制,計算抑制百分比。

 

qPCR和Crystal dPCR對抑制劑的耐受性比較

 

我們在qPCR和Crystal dPCR平臺比較了存在兩種在樣品中發現的已知抑制劑對DNA定量分析的影響,分別是在土壤樣本中存在的腐殖酸和在收集的血樣中用作抗凝血劑的肝素。結果顯示,與qPCR相比,Crystal dPCR在任何較高濃度抑制劑存在的情況下,仍然可以進行準確定量(圖3)。

 

圖3. 不同濃度的腐殖酸(A)和肝素(B)對qPCR和Crystal dPCR的抑制。

 

qPCR和Crystal dPCR反應包含PerfeCta Multiplex qPCR Toughmix,相同量的人類基因組DNA,以及測試腐殖酸抑制作用的靶向BRAF基因和測試肝素抑制作用的EGRF基因的引物和探針。所有樣品進行2次實驗,每次實驗三個重復(利用Sigmoid即S型函數擬合)。以不添加抑制劑的DNA定量為0%抑制,計算抑制百分比。

 

綜上所述,當對存在抑制劑的樣品進行DNA/RNA分析時,Crystal dPCR可以比qPCR的結果更為可靠。Crystal dPCR是您一直在尋找的針對含抑制劑樣本中核酸檢測和定量的最佳解決方案。

發布者:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
聯系電話:0512--86860010
E-mail:info@aperbio.com

標簽: naica qPCR dPCR
用戶名: 密碼: 匿名 快速注冊 忘記密碼
評論只代表網友觀點,不代表本站觀點。 請輸入驗證碼: 8795
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網 電話:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com
主站蜘蛛池模板: 天镇县| 霞浦县| 德安县| 溆浦县| 花垣县| 项城市| 句容市| 抚顺市| 娱乐| 盐源县| 方城县| 灌云县| 康平县| 禄劝| 剑川县| 丰顺县| 政和县| 关岭| 汕头市| 漠河县| 易门县| 明溪县| 高雄市| 重庆市| 凌源市| 江北区| 集安市| 丹凤县| 界首市| 平罗县| 固镇县| 左贡县| 安徽省| 织金县| 翁牛特旗| 永胜县| 河津市| 团风县| 改则县| 昔阳县| 公安县|