九叔归来3魁蛊婴在线观看_男人躁女人到高潮AV_香港成人论坛_亚洲精品久久久久久偷窥_夜来香成人网_亚洲制服 视频在线观看_无毒黄站_国产传媒18精品A片一区_麻花豆传媒剧国产MV在线观看_东北60岁熟女露脸在线_国产高清视频在线观看97_一道本视频一二三区_yellow免费播放在线观看_浪漫樱花动漫在线观看官网_高清AV熟女一区_天堂在线www_亚洲第一成年人网站_黄色在线免费观看_av女优快播_久久精品99国产精品日本

English | 中文版 | 手機版 企業(yè)登錄 | 個人登錄 | 郵件訂閱
當前位置 > 首頁 > 技術文章 > 新一代Fluidigm 微流體芯片PCR技術在農(nóng)業(yè)中的應用

新一代Fluidigm 微流體芯片PCR技術在農(nóng)業(yè)中的應用

瀏覽次數(shù):5033 發(fā)布日期:2011-6-17  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責任自負

通過對單核苷酸多態(tài)性(SNP)的篩查,對育種分類,鑒定,改良,及進行動植物管理, 為現(xiàn)代農(nóng)業(yè)帶來巨大改變。但采用有關方法前, 需要對物種進行大規(guī)模的篩選研究。市場上Affymetrix公司提供的芯片可掃描500,000到900,000個SNPs位點而Illumina公司 的BeadChips可掃描300,000到2,500,000 個SNPs位點等,但此等芯片,在高通量樣本下成本將變得非常昂貴。遺傳學家需要一個高通量,高精確度但成本劃算的篩查方法 -Fluidigm公司的微流體芯片應用PCR 原理,進行于鑒別基因變異——單核苷酸多態(tài)性(SNP)篩查, 特別適合SNPs位點(約50-300)的快速的大規(guī)模樣本(樣本量達數(shù)千以上)的篩選。
我所欲也
美國阿拉斯加漁業(yè)局研究主管Jim Seeb和他的妻子Lisa 在大約20年前就采用SNPs作為遺傳標記來鑒定三文魚群體并以此管理捕撈業(yè)。在2008年1年中,阿拉斯加基因?qū)嶒炇也捎肁pplied Biosystem的384孔PCR系統(tǒng)對大約30,000條三文魚進行基因分型。如能對45個SNPs位點進行鑒定,但也產(chǎn)生1,350,000個數(shù)據(jù)點 (45x30,000), 如使用傳統(tǒng)384孔板及單通道PCR, 45塊384孔板只能處理384個樣本,所有樣本需要 78x45塊共3516塊板和大量試劑!但當他們發(fā)現(xiàn)了 Fluidigm 公司的BioMark 系統(tǒng)后,他們可一次檢測96個SNP點,將實驗質(zhì)量大大提升,使用極小量試劑和一塊BioMark Dynamic Array可一次同時分析96個不同樣本的96個SNPs位點(9216個數(shù)據(jù))。“這是一種更簡易和更少出錯的工作流程”Seeb說。現(xiàn)在,該實驗室每天在9臺Fluidigm的PCR儀上進行16塊芯片的實驗,每周4天,并計劃在2011年對200,000條三文魚進行基因分型。“沒有此項技術,我們根本無法完成這樣的任務”漁業(yè)局首席遺傳學專家Bill Templin說。
- 我所欲也,魚與牛皆可得也!
2009年的春天, 美國農(nóng)業(yè)部的一位遺傳學專家Curt Van Tassell正在尋找一種方法來對世界上每一頭奶牛進行基因分型。在過去的10年中,Curt已經(jīng)研究了數(shù)百頭重要的奶牛的SNPs,希望找出其對生長速度、產(chǎn)奶產(chǎn)量、奶牛健康、壽命等關系。Curt與美國Illumina公司合作在2007年研發(fā)出一種有54,000個SNPs位點的3μm微球芯片,并很快應用該技術于奶牛公牛的篩選。然而,采用該項技術,每頭公牛的鑒定成本大約需要150-200美元,須然如此昂貴,但很多的公牛也會接受分子育種檢測, 幫助農(nóng)民估計公牛的價值。為了要把技術推廣到每一頭奶牛、每個小規(guī)模農(nóng)場甚至是非洲等第三世界國家,該費用還需要大大降低。于是,在2009年春天,當Curt 從一家三文魚公司和種子基因分型公司那里知道Fluidigm公司基因分型平臺后,馬上接觸Fluidigm公司。然而,Curt要求的是一個足夠便宜的工具能用于類似非洲等世界上最窮的農(nóng)場, 成本需要比Fluidigm公司已有平臺更低才可以!為了達到把成本下降到“現(xiàn)在每個數(shù)據(jù)成本的1/3到1/5”,F(xiàn)luidigm 公司經(jīng)過將近1年的努力,終于在2010年7月初,推出世界上第一個可重復使用的微流體芯片。使用可重復使用的芯片,每個數(shù)據(jù)點的花費大約為<0.02美元。離Fluidigm公司的目標1便士1個數(shù)據(jù)點的愿望,或許在第二代可重復使用芯片誕生時即可實現(xiàn)。
種子農(nóng)友的成功基礎!
全球首屈一指的農(nóng)用優(yōu)質(zhì)蔬菜種子供應商Enza Zaden公司選用Fluidigm的BioMark™系統(tǒng)和新款96.96動態(tài)陣列(Dynamic Array)來確保其種子供應的質(zhì)量。在全球糧食供應方面,對高產(chǎn)和抗病作物的需求越來越大,因此,市場仍然迫切需要各類優(yōu)質(zhì)種子,用來種植味美又營養(yǎng)的蔬菜。不同的土壤特性和氣候帶會影響作物的生長,我們的地球不再是同一類種子能滿足每個人需求的地方了。面對這樣的情況,Enza Zaden公司采用基于遺傳的標記物輔助篩選技術來選種,并對幾十萬的種子進行檢查,以確保能長出恰好符合人們口味的作物產(chǎn)品,并對合適的品種進行育種,滿足每個人的需求。
人類與疾病?
自人類基因組計劃在2001年發(fā)布后,科學家們嘗試通過GWAS研究將SNPs與人類特征與疾病關聯(lián)起來。盡管花費了大量的經(jīng)費和時間,然而很多的GWAS研究并不能很好揭示它們之間有緊密的聯(lián)系。因此,科學家急切需要一種工具去驗證某種疾病與SNPs的關聯(lián),需要的是一種能快速驗證及重復性良好的工具。“如果你正在做大規(guī)模的驗證實驗,你需要最便宜、高質(zhì)量的結(jié)果”,牛津大學維康信托基金會人類遺傳中心 (Wellcome Trust Centre for Human Genetics at the University of Oxford) 基因組首席基因組學專家Jiannis Ragoussis說。一些研究機構已經(jīng)開始使用Fluidigm的芯片進行該項研究,包括美國國家癌癥研究所(NCI),他們在進行60個SNP位點、15,000個樣本的前列腺癌GWAS后續(xù)研究。“該芯片或許能夠在更廣闊的領域發(fā)揮其作用”,Ragoussis補充道。如果研究者們證明了近百個SNP位點,如50-100個,可以為醫(yī)生提供有用的信息,那么,也許有一天,將會有癌癥芯片、糖尿病芯片、心臟病芯片……
 
改編 :http://classic.the-scientist.com/article/display/57843/

發(fā)布者:廣州進科馳安科技有限公司
聯(lián)系電話:17620093784
E-mail:marketing@bio-gene.com.cn

用戶名: 密碼: 匿名 快速注冊 忘記密碼
評論只代表網(wǎng)友觀點,不代表本站觀點。 請輸入驗證碼: 8795
Copyright(C) 1998-2025 生物器材網(wǎng) 電話:021-64166852;13621656896 E-mail:info@bio-equip.com
主站蜘蛛池模板: 舞钢市| 宜川县| 札达县| 白银市| 阿合奇县| 灵寿县| 阿合奇县| 盈江县| 宜昌市| 遂川县| 嘉定区| 辽中县| 裕民县| 资源县| 伊春市| 桃园县| 宝兴县| 德清县| 乐都县| 安福县| 沙湾县| 封丘县| 昌江| 茶陵县| 玉龙| 钟祥市| 唐海县| 定安县| 大宁县| 郁南县| 鄂尔多斯市| 鄯善县| 繁昌县| 盈江县| 延庆县| 平度市| 丹凤县| 五原县| 新安县| 新津县| 定西市|