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新HIV整合酶與侵入抑制劑治療相關(guān)的耐藥性和嗜性新觀點

瀏覽次數(shù):2879 發(fā)布日期:2009-11-20  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

454 測序研究揭示新HIV 整合酶與侵入抑制劑治療相關(guān)的耐藥性和嗜性新觀點

研究結(jié)果也許能作為未來治療HIV病患的潛在治療方案

加拿大蒙特利爾召開的第16屆逆轉(zhuǎn)錄病毒及機(jī)會性感染會議(CROI)上公布的兩項研究的最新數(shù)據(jù)證明,羅氏旗下454生命科學(xué)公司Genome Sequencer FLX系統(tǒng)的超深度測序(ultra-deep sequencing)與傳統(tǒng)方法相結(jié)合,有望加深對病毒抗性和嗜性的基本了解,從而促進(jìn)未來可供HIV病人選擇的新藥開發(fā)。用于綜合治療的有效藥物篩選是確保病人可以最佳方式長期抑制HIV及防止疾病向艾滋病(AIDS)方向發(fā)展的關(guān)鍵。

逆轉(zhuǎn)錄病毒及機(jī)會性感染會議(CROI)上公布的研究結(jié)果由羅馬大學(xué)Tor Vergata和Virco BVBA的科學(xué)家在Virco實驗室最新進(jìn)行的系列聯(lián)合研究中完成。研究人員分析和解釋了用Genome Sequencer FLX系統(tǒng)對HIV感染樣品進(jìn)行測序所得到的結(jié)果。這項研究探討了HIV對一種叫做整合酶抑制劑的新型藥物的耐藥性,并且深入研究了病毒嗜性。454測序系統(tǒng)的超深度方法比較于傳統(tǒng)的測序方法,能顯著提高檢測低頻病毒變異--即病毒準(zhǔn)種的靈敏性。

第一項研究分析了長期接受抗逆轉(zhuǎn)錄病毒治療的患者在接受整合酶抑制劑raltegravir和優(yōu)化核心療法的綜合治療的情況。這項研究在多個時間點對樣品同時進(jìn)行多種分析,包括傳統(tǒng)Sanger基因分型、體外表型分型和超深度測序。結(jié)果研究人員發(fā)現(xiàn),治療失敗的病人體內(nèi)存在多種病毒準(zhǔn)種,其水平遠(yuǎn)低于常規(guī)檢測下限,而治療成功的病患體內(nèi)這樣的病毒準(zhǔn)種數(shù)量要少得多。研究人員推測許多不同株的病毒共存或許有利于耐藥性的發(fā)展,并最終導(dǎo)致治療失敗。

研究人員進(jìn)一步提出,在基線水平上鑒別的病毒準(zhǔn)種與治療失敗之間的相關(guān)性可能以一種更復(fù)雜的途徑發(fā)生,其復(fù)雜性超過了目前已知的由單純藥物驅(qū)動的初級突變選擇。Vergata大學(xué)Perno教授表示,“454測序技術(shù)的這種可識別極低水平突變的能力,為研究HIV如何對新藥(比如整合酶抑制劑)產(chǎn)生耐藥性提供了新觀點”,他的同事Ceccherini-Silberstein博士補(bǔ)充道,“這項技術(shù)可完善現(xiàn)有的技術(shù),也為HIV研究提供了顯著的增值價值。”在第二項研究中,研究人員對來自HIV感染患者的分離病毒株進(jìn)行分析,包括傳統(tǒng)的表型分型和基因型分型,以及深度測序分析,以了解HIV病毒嗜性。HIV嗜性是指一個病人特定的HIV病毒在進(jìn)入人類CD4細(xì)胞進(jìn)行繁殖時選擇CCR5、CXCR4兩個協(xié)同受體中的哪一個的偏向性。確定一個HIV病毒株采用的協(xié)同受體是CCR5、CXCR4,還是兩者的結(jié)合正是監(jiān)控和治療HIV的一個關(guān)鍵步驟。雙嗜性(dual tropic)病毒能利用協(xié)同受體中的任一個或者兩個以進(jìn)入細(xì)胞。在這項研究中,研究人員利用454測序系統(tǒng)V3深度測序分析了10個隨機(jī)挑選的雙嗜性分離株,并在人類免疫細(xì)胞中研究其對包含CCR5拮抗劑和CXCR4拮抗劑AMD3100的治療方案的敏感性。

通過這些樣品,研究人員發(fā)現(xiàn)雙嗜性病毒大多屬于可能使用R5和CXCR4受體的準(zhǔn)種,而不是使用R5和X4受體的準(zhǔn)種,這是有關(guān)HIV病毒如何適應(yīng)性選擇進(jìn)入人類目標(biāo)細(xì)胞CD4細(xì)胞的協(xié)同受體的一種新觀點。VIRCO BVBA研發(fā)部副主席Lieven Stuyver博士表示,“這種分析有助于更好的理解HIV協(xié)同受體嗜性的復(fù)雜機(jī)制”,“我們相信,應(yīng)用目前的技術(shù)比如表型分型,結(jié)合新型技術(shù)比如Genome Sequencer FLX系統(tǒng)超深度測序?qū)εR床結(jié)果數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,也許能揭示這些復(fù)雜病毒機(jī)制,并最終達(dá)到更好的HIV治療效果。”

454生命科學(xué)公司總裁,首席執(zhí)行官Christopher McLeod表示,“這些研究都證明了454測序能用于病毒疾病以及潛在治療方法的研究”,“開發(fā)創(chuàng)新的治療方法,比如新型HIV藥物,常常需要伴隨合適的工具以便為特定的病人恰當(dāng)?shù)剡x擇合適的治療方案。我們相信,在不遠(yuǎn)的將來,454測序系統(tǒng)的靈敏度,準(zhǔn)確度和速度必將有助于改變監(jiān)控和治療HIV的方式。”

發(fā)布者:羅氏診斷產(chǎn)品(上海)有限公司
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