對于科研人員來說，采用一項(xiàng)新技術(shù)開展課題研究無疑是令人激動(dòng)的。除了可以學(xué)習(xí)新的技能以外，利用新技術(shù)還有可能收獲意想不到的研究成果。然而面對一項(xiàng)新技術(shù)，往往也會(huì)產(chǎn)生很多疑問：采用這新技術(shù)能為我的課題研究帶來什么？如何將新技術(shù)巧妙地應(yīng)用到我的研究之中？不同人對于技術(shù)的應(yīng)用方法及其背后理論的理解是不同的。

北京大學(xué)苗成林教授曾就空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)接受10x Genomics的采訪，他采用空間基因表達(dá)來研究退行性腦病。小編為大家截取部分內(nèi)容，希望通過分享他的故事和見解能夠幫助你撥開空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)迷霧，決定是否要采用此技術(shù)開展你的課題研究。

Q：你能描述一下你目前的研究項(xiàng)目嗎?你是如何開始對這個(gè)領(lǐng)域感興趣的?

A：我研究大腦空間表征系統(tǒng)（海馬體和內(nèi)嗅皮層）的分子差異，重點(diǎn)是衰老如何影響這一系統(tǒng)。具體來說，我的實(shí)驗(yàn)室研究的是海馬體中的放置細(xì)胞和內(nèi)嗅皮層中的網(wǎng)格細(xì)胞，它們構(gòu)成了行為和記憶中位置、路徑和相關(guān)經(jīng)驗(yàn)的定量時(shí)空表征的基礎(chǔ)。

根據(jù)世界衛(wèi)生組織的數(shù)據(jù)，到2050年，60歲以上的人口將增加到20億。盡管老年人反應(yīng)他們的導(dǎo)航能力大幅下降，但大多數(shù)關(guān)于衰老的研究都集中在記憶和注意力的變化上，而不是空間導(dǎo)航。然而，我們知道，大腦導(dǎo)航系統(tǒng)的關(guān)鍵結(jié)構(gòu)特別容易受到衰老的有害后果的影響。在記錄幼年和老年小鼠的位置細(xì)胞時(shí)，我們發(fā)現(xiàn)，衰老導(dǎo)致了視野大小、放電率、穩(wěn)定性和解碼準(zhǔn)確性的差異。

Q:是什么促使你考慮使用空間技術(shù)來探索你的研究問題?

A：在我們的小鼠模型中，我們希望看到衰老導(dǎo)致的內(nèi)耳-海馬網(wǎng)絡(luò)的同步或相關(guān)變化。由于區(qū)隔是大腦的基本特征，了解不同部位（在組織中）如何協(xié)同工作是至關(guān)重要的。

Q：你認(rèn)為空間方法可以解決任何技術(shù)限制或?qū)嶒?yàn)挑戰(zhàn)嗎?

A：單細(xì)胞RNA測序（scRNA-seq）需要生成單細(xì)胞懸浮液，這在老年小鼠中很難產(chǎn)生。Visium Spatial Gene Expression空間技術(shù)利用組織切片作為輸入，從而克服了scRNA-seq的這一挑戰(zhàn)。

Q：你認(rèn)為空間方法可以解決任何技術(shù)限制或?qū)嶒?yàn)挑戰(zhàn)嗎?

A：單細(xì)胞RNA測序（scRNA-seq）需要生成單細(xì)胞懸浮液，這在老年小鼠中很難產(chǎn)生。Visium Spatial Gene Expression空間技術(shù)利用組織切片作為輸入，從而克服了scRNA-seq的這一挑戰(zhàn)。

Q：采用空間方法如何影響你的下一個(gè)研究問題或后續(xù)實(shí)驗(yàn)?

A：空間方法為我的數(shù)據(jù)提供了一個(gè)更好的、更一般化的視圖，使我的科學(xué)問題能夠得到詳細(xì)的驗(yàn)證和探索。具體來說，我們希望利用Visium空間技術(shù)來探索解釋幼齡和老年小鼠內(nèi)耳-海馬表征差異的分子機(jī)制。我們目前正在生成這些數(shù)據(jù)，并期待在未來將其發(fā)布。