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病毒蛋白樣半胱氨酸蛋白酶在抗COVID-19藥物設(shè)計(jì)的結(jié)構(gòu)框架的應(yīng)用

瀏覽次數(shù):1487 發(fā)布日期:2020-5-8  來源:本站 僅供參考,謝絕轉(zhuǎn)載,否則責(zé)任自負(fù)

2020年4月29日,由Wioletta Rut, Mikolaj Zmudzinski等人在bioRxiv期刊發(fā)表了《Activity profiling of SARS-CoV-2-PLpro protease provides structural framework for anti-COVID-19 drug design》的文章,文中使用Sappphire對(duì)B-Ub-VME標(biāo)記SARS-CoV和SARS-CoV-2-PLpro蛋白進(jìn)行掃描成像,并使用Azure spot軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。

文章摘要

病毒蛋白樣半胱氨酸蛋白酶(PLpro, NSP3)是SARS-CoV-2抗病毒藥物研發(fā)的一個(gè)潛在靶點(diǎn),有助于藥物研發(fā),在這里,我們使用含有天然和多種非蛋白質(zhì)的組合底物文庫(kù),并對(duì)SARS-CoV-2-PLpro進(jìn)行了全面的活性分析。我們發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2-PLpro的P2位點(diǎn)對(duì)Gly具有高度特異性,P3位點(diǎn)表現(xiàn)出很高的非特異性,P4位點(diǎn)優(yōu)先顯示結(jié)合具有疏水性的氨基酸側(cè)鏈。

我們還證明了SARS-CoV-2-PLpro具有去泛素化活性,底物結(jié)合特征曲線和去泛素化活性高度相關(guān)。在定位掃描的基礎(chǔ)上,我們?cè)O(shè)計(jì)了最佳的熒光基質(zhì)和不可逆抑制劑,研究SARS PLpro變體對(duì)其他蛋白酶的選擇性。總之,這項(xiàng)工作揭示了控制PLpro底物特異性的分子規(guī)則,并為開發(fā)具有潛在治療價(jià)值的藥物提供了框架。

文中使用Sappphire對(duì)B-Ub-VME標(biāo)記SARS-CoV和SARS-CoV-2-PLpro蛋白進(jìn)行掃描成像,并使用Azure Spot軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。

發(fā)布者:艾普拜生物科技(蘇州)有限公司
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