2020年4月29日，由Wioletta Rut, Mikolaj Zmudzinski等人在bioRxiv期刊發(fā)表了《Activity profiling of SARS-CoV-2-PLpro protease provides structural framework for anti-COVID-19 drug design》的文章，文中使用Sappphire對(duì)B-Ub-VME標(biāo)記SARS-CoV和SARS-CoV-2-PLpro蛋白進(jìn)行掃描成像，并使用Azure spot軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。

文章摘要

病毒蛋白樣半胱氨酸蛋白酶(PLpro, NSP3)是SARS-CoV-2抗病毒藥物研發(fā)的一個(gè)潛在靶點(diǎn)，有助于藥物研發(fā)，在這里,我們使用含有天然和多種非蛋白質(zhì)的組合底物文庫(kù)，并對(duì)SARS-CoV-2-PLpro進(jìn)行了全面的活性分析。我們發(fā)現(xiàn)SARS-CoV-2-PLpro的P2位點(diǎn)對(duì)Gly具有高度特異性，P3位點(diǎn)表現(xiàn)出很高的非特異性，P4位點(diǎn)優(yōu)先顯示結(jié)合具有疏水性的氨基酸側(cè)鏈。

我們還證明了SARS-CoV-2-PLpro具有去泛素化活性，底物結(jié)合特征曲線和去泛素化活性高度相關(guān)。在定位掃描的基礎(chǔ)上，我們?cè)O(shè)計(jì)了最佳的熒光基質(zhì)和不可逆抑制劑，研究SARS PLpro變體對(duì)其他蛋白酶的選擇性。總之，這項(xiàng)工作揭示了控制PLpro底物特異性的分子規(guī)則，并為開發(fā)具有潛在治療價(jià)值的藥物提供了框架。

文中使用Sappphire對(duì)B-Ub-VME標(biāo)記SARS-CoV和SARS-CoV-2-PLpro蛋白進(jìn)行掃描成像，并使用Azure Spot軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。