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數字PCR應用文獻:兩種多重數字PCR試劑檢測EGFR的活化和耐藥位點

瀏覽次數:5814 發布日期:2019-5-15  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

數字PCR應用文獻---

兩種多重數字PCR試劑檢測EGFR的活化和耐藥位點


NaicaTMcrystal數字PCR
 
通常生物學樣本量有限,通過單次實驗獲得足夠多的信息對于研究人員和診斷人員至關重要。NaicaTMcrystal數字PCR系統實現了單次實驗中同時檢測和定量多重生物標志物,并確保數據精準度和可信度,通過3個不同的熒光通道,非常明確地區分靶標位點。這種簡單快速的技術平臺能夠兼容多種熒光染料組合,大大地擴展了實驗設計的可能性。
在NSCLC(非小細胞肺癌)治療中,EGFR(表皮生長因子受體)是種常見的藥物作用靶點。EGFR活化突變位點,如L858R,L861Q和19外顯子缺失用于預測TKIs(酪氨酸激酶抑制劑)藥物藥效,同時EGFR T790M突變用于一代TKIs藥物耐藥預測。
 
為了在不犧牲結果的準確性和可靠性的情況下,在單個測試中檢測這些突變的數量,開發了兩個多重方法。引物和探針使用NaicaTMcrystal數字PCR系統三種不同熒光通道,在Panel1中可同時檢測EGFR L858R、L861Q、T790M和野生型EGFR,在Panel2中可以同時檢測19外顯子缺失、T790M和野生型EGFR。所有的assays都在400copise/ul野生型DNA 背景下,EGFR突變等位基因的頻率分別為0.25%和0.1%(如圖)

這兩個3色數字PCR檢測EGFR試劑盒檢測非小細胞肺癌患者跟NGS比較,測得的突變等位基因EGFR片段具有較強的相關性。(如圖)
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