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種子的SSR檢測——高通量前處理解決方案

瀏覽次數:4886 發布日期:2016-11-29  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負

美國SPEX SamplePrep公司擁有60余年的專業樣品前處理儀器生產經驗和專業背景。SPEX GENO高通量組織研磨儀,開始是專門為杜邦旗下先鋒良種農業(PIONEER)植物樣品而研發。

SSR(又稱微衛星DNA)標記,由于其共顯性遺傳特點,可以鑒定雜合子和純合子。該標記法需要DNA量少,實驗重復性好,可靠性高,操作簡便、經濟,因而已經成為種子鑒定中最常用的分子鑒定方法,并已經出現在一些種子真實性和純度檢測的標準中。

為了真正實現極高通量檢測,在96孔深孔板的單孔中如能對單粒種子成功粉碎將是非常理想的。我們知道要將種子磨碎并不難,但要在如此狹小的空間內將堅硬的種子磨碎就不那么容易實現了。SPEX高通量組織研磨儀能輕松達到這一目的。培安公司應用工程師已整理出上百種樣品的最佳前處理方案,下圖為部分種子的研磨效果(每個圖都是96孔深孔板單孔研磨單粒種子的結果):

         

值得注意的是,大麥、綠豆、黃豆這些帶皮的種子,無須剝皮,研磨完成外皮自然脫落;像黃豆這樣堅硬的種子,在單孔也成功粉碎;像葵花籽這樣油性的種子,研磨結果雖有些結塊,但是也呈泥漿狀,擁有很好的細度。唯獨玉米種子單粒較大,無法放入深孔板單孔中,但當我們將玉米種子放入15ml管中,也獲得了下圖的研磨效果:

             玉米

我們知道,在進行種子真實性和純度檢測時,每個品種需要做一定數量的重復,尤其純度檢測時,至少需要100粒種子。在SSR分子標定步驟的第一步就需要破碎種子并提取DNA,這是一個非常繁重的手工勞動。如果SPEX Geno 加入工作,就可以一個人在幾分鐘之內就獲得所有待測種子的模板DNA!而這往往是需要一個人幾個工作日的勞動量!

Geno 2010一次可處理6塊96孔深孔板,也就是說一次即可完成576個種子的DNA提;一次可處理24個15ml管,像玉米這樣的大顆粒種子,一次也可以做24個不同樣品的DNA提取。

種子檢測領域和遺傳育種領域的樣品通量極高是眾所周知的,也是讓科研工作者頗為傷腦筋的問題。培安技術中心的應用工程師可根據您的樣品為您提供方案,使得所有繁瑣的前處理問題迎刃而解。

愿培安公司專業的前處理儀器和技術服務能早日為您的科研事業添磚加瓦。

發布者:培安有限公司
聯系電話:010-65528800
E-mail:sales@pynnco.com

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