微量轉(zhuǎn)錄組測序揭示TET酶在動物卵母細(xì)胞成熟和孤雌胚胎發(fā)育中的作用
易小結(jié)
單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)為探明哺乳動物卵母細(xì)胞早期生長分子機制提供了新機遇。此前，單細(xì)胞DNA甲基化（scBS-seq）與轉(zhuǎn)錄組測序（Smart-seq2）已揭示豬生發(fā)泡卵母細(xì)胞成熟的關(guān)鍵調(diào)控機制，闡明了減數(shù)分裂停止到恢復(fù)的分子過程（詳見：項目文章 | 單細(xì)胞DNA甲基化與轉(zhuǎn)錄組分析揭示豬生發(fā)泡卵母細(xì)胞成熟的關(guān)鍵調(diào)控機制）。TET家族酶在基因組去甲基化中扮演重要角色，對胚胎發(fā)育和干細(xì)胞多能性至關(guān)重要，但在豬卵母細(xì)胞中的具體功能仍需深入探究。
本研究發(fā)現(xiàn)TET家族酶（TET1、TET2、TET3）在豬卵母細(xì)胞成熟和孤雌胚胎發(fā)育中發(fā)揮關(guān)鍵作用。Bobcat339處理通過改變5mC和5hmC水平，顯著影響卵母細(xì)胞成熟、紡錘體結(jié)構(gòu)、染色體排列及胚胎發(fā)育進(jìn)程。此外，TET酶還通過調(diào)控合子基因組激活（ZGA）及多能性相關(guān)基因的表達(dá)，進(jìn)一步影響胚胎發(fā)育。這些發(fā)現(xiàn)為理解TET家族在哺乳動物胚胎發(fā)育中的功能提供了新視角。
Smart-seq2技術(shù)是本研究的核心支持，其高通量轉(zhuǎn)錄組分析揭示了Bobcat339處理后胚胎的差異表達(dá)基因及發(fā)育停滯的分子機制。該技術(shù)為深入理解胚胎發(fā)育分子過程提供了重要線索和數(shù)據(jù)支持，為后續(xù)基因功能驗證及豬生殖生物學(xué)和胚胎工程研究奠定了堅實的理論基礎(chǔ)。
研究摘要
近日，湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所陳礬博士（助理研究員）為第一作者，黃濤副研究員和畢延震研究員為共同通訊，在《International Journal of Molecular Sciences》（Int. J. Mol. Sci. ）期刊發(fā)表題為《TET Family Members Are Integral to Porcine Oocyte Maturation and Parthenogenetic Pre-Implantation Embryogenesis》的科研成果。研究通過使用Bobcat339（一種特異性的小分子TET家族抑制劑）處理以抑制TET酶活性，進(jìn)而觀察其對豬卵母細(xì)胞成熟和早期胚胎發(fā)育的影響。研究結(jié)果揭示了TET家族酶在調(diào)控豬卵母細(xì)胞成熟、紡錘體結(jié)構(gòu)、染色體排列以及胚胎發(fā)育過程中5mC和5hmC水平的關(guān)鍵作用。研究闡明了TET酶在豬卵母細(xì)胞成熟和孤雌胚胎發(fā)育中的具體作用機制，為理解哺乳動物胚胎發(fā)育的表觀遺傳調(diào)控提供新的視角。此外研究結(jié)果也為豬的生殖生物學(xué)和胚胎工程提供重要理論基礎(chǔ)，有助于優(yōu)化豬的繁殖技術(shù)和胚胎發(fā)育調(diào)控策略。
標(biāo)題：TET Family Members Are Integral to Porcine Oocyte Maturation and Parthenogenetic Pre-Implantation Embryogenesis（TET家族成員對豬卵母細(xì)胞成熟和孤雌胚胎發(fā)育至關(guān)重要）
發(fā)表時間：2023-08-05
發(fā)表期刊：Int. J. Mol. Sci.
影響因子：IF 5.6/Q2
技術(shù)平臺：Smart-seq2等
研究方法
樣本收集：從雌豬卵巢中分離3-6 mm的卵泡，收集帶有均勻細(xì)胞質(zhì)和多層卵丘細(xì)胞的卵丘卵母細(xì)胞復(fù)合體（cumulus oocyte complexes, COCs）。
體外成熟（IVM）：將COCs在培養(yǎng)基中培養(yǎng)，添加促性腺激素（eCG和hCG）以促進(jìn)卵母細(xì)胞成熟。
孤雌激活：去除卵丘細(xì)胞后，激活卵母細(xì)胞，激活后的卵母細(xì)胞在培養(yǎng)基中培養(yǎng)。
Bobcat339處理：將Bobcat339溶解于DMSO中，稀釋至不同濃度（0μM、50μM、100μM、200μM、400μM），添加到成熟培養(yǎng)基中以抑制TET酶活性。
檢測方法：
免疫熒光染色：檢測5mC和5hmC水平。
qRT-PCR：用于檢測基因表達(dá)水平。
微量RNA測序（Smart-seq2）：分析胚胎轉(zhuǎn)錄組的變化。
結(jié)果圖形
（1）Bobcat339處理阻斷豬卵母細(xì)胞第一極體（First Polar Body）排出
實驗中，不同濃度的Bobcat339處理顯著降低了豬卵母細(xì)胞第一極體排出率（PBE），表現(xiàn)為濃度依賴性。在200μM和400μM濃度下，PBE率顯著下降，表明Bobcat339抑制TET酶活性后，卵母細(xì)胞成熟過程受到阻礙。
（B）經(jīng)100μM、200μM和400μM Bobcat339處理后，第一極體排出（PBE）率顯著降低。
（C）對照組和經(jīng)200μM Bobcat339處理的卵母細(xì)胞在體外培養(yǎng)44小時后的第一極體排出的代表性圖像。
（2）經(jīng)Bobcat339處理引發(fā)豬卵母細(xì)胞凋亡
通過Annexin-V-FITC染色檢測早期凋亡水平，發(fā)現(xiàn)Bobcat339處理后的卵母細(xì)胞早期凋亡率顯著增加。此外，BAX和BCL-2的mRNA水平顯著升高，BAX/BCL-2比值顯著上升，表明TET酶抑制導(dǎo)致卵母細(xì)胞早期凋亡。
（B）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中帶有Annexin-V信號的卵母細(xì)胞比例。
（C）qRT-PCR檢測對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞BAX、BCL-2、BAX/BCL-2的mRNA水平。
（3）Bobcat339對卵母細(xì)胞紡錘體結(jié)構(gòu)和染色體排列的作用
使用α-tubulin染色觀察紡錘體形態(tài)，結(jié)果顯示Bobcat339處理的卵母細(xì)胞紡中錘體結(jié)構(gòu)異常，染色體排列分散。與對照組相比，異常紡錘體和染色體排列比例顯著增加，表明TET酶對卵母細(xì)胞的紡錘體結(jié)構(gòu)和染色體排列具有重要作用。
（B）經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中異常紡錘體比例顯著增加。
（C）經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中染色體錯位比例顯著升高。
（4）Bobcat339處理導(dǎo)致豬卵母細(xì)胞中的5mC/5hmC水平發(fā)生變化
免疫熒光染色結(jié)果顯示，Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中5hmC信號顯著降低，而5mC信號顯著增加。定量分析進(jìn)一步驗證這一結(jié)果，表明TET酶通過調(diào)節(jié)5mC和5hmC水平影響卵母細(xì)胞成熟。
（B）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中5hmC的熒光強度。
（C）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中5mC的免疫熒光染色。
（D）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中5mC的平均熒光強度。
（5）Bobcat339對胚胎發(fā)育的影響
在孤雌胚胎發(fā)育實驗中，不同濃度的Bobcat339處理顯著降低了胚胎發(fā)育到囊胚階段的比例。胚胎在4細(xì)胞階段停滯，表明Bobcat339抑制TET酶活性后，胚胎發(fā)育受到嚴(yán)重影響。
圖5：Bobcat339處理抑制了豬的早期胚胎發(fā)育。
（A）對照組和經(jīng)Bobcat339處理（25、50和100 μM）的孤雌激活豬胚胎在第6天囊胚形成的圖像。
（B）對照組和經(jīng)Bobcat339處理組中發(fā)育到囊胚階段的激活卵母細(xì)胞比例。
（C）對照組和經(jīng)Bobcat339處理（25、50和100 μM Bobcat339）組中第3天不同階段的胚胎比例。
（6）Bobcat339處理降低了ZGA和多能性相關(guān)基因的表達(dá)
qRT-PCR檢測結(jié)果顯示，Bobcat339處理后，合子基因組激活（zygotic gene activation，ZGA）標(biāo)記基因（如EIF1A和DPPA2）以及多能性相關(guān)基因（如OCT4和NANOG）的mRNA水平顯著下降，表明Bobcat339處理破壞了ZGA，影響胚胎發(fā)育。
圖6：Bobcat339處理阻斷了ZGA和多能性基因的表達(dá)。
（A）經(jīng)Bobcat339處理的胚胎中，EIF1A和DPPA2的mRNA水平顯著降低。
（B）經(jīng)Bobcat339處理的胚胎中，OCT4和NANOG的mRNA水平降低；SOX2的mRNA水平則沒有變化。
（C）Bobcat339處理后，H19的mRNA水平未受影響。
（7）Bobcat339處理影響豬胚胎中的5mC/5hmC水平
免疫熒光染色和定量分析顯示，Bobcat339處理的胚胎中5hmC水平顯著降低，而5mC水平顯著增加，表明TET家族酶通過調(diào)節(jié)5mC和5hmC水平影響胚胎發(fā)育。
圖7：Bobcat339處理影響豬胚胎中的5mC和5hmC水平。
（A-B） 對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎在2細(xì)胞和4細(xì)胞階段的5hmC免疫熒光染色。
（C-D） 對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎在2細(xì)胞和4細(xì)胞階段的5mC免疫熒光染色。
（E-F） 在對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎中，2細(xì)胞和4細(xì)胞階段的5hmC熒光強度。
（G-H） 在對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎中，2細(xì)胞和4細(xì)胞階段的5mC平均熒光強度。
（8）微量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比較分析
通過Smart-seq2技術(shù)對4細(xì)胞階段的胚胎進(jìn)行RNA測序分析，分析結(jié)果鑒定出Bobcat339處理后胚胎中的203個差異表達(dá)基因（DEGs），其中75個上調(diào)基因，128個下調(diào)基因。基因本體（GO）分析顯示，這些差異表達(dá)基因主要富集在細(xì)胞增殖、細(xì)胞組分與線粒體相關(guān)以及細(xì)胞黏附分子結(jié)合等生物學(xué)過程中。
圖8：對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎之間的差異基因表達(dá)模式。
（A）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎在4細(xì)胞階段的mRNA水平的主成分分析（PCA）。
（B）對照組和經(jīng)Bobcat339處理組之間的基因表達(dá)和分布的小提琴圖。
（C）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎在4細(xì)胞階段的差異表達(dá)基因（DEGs）的分層聚類。
（D）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎在4細(xì)胞階段DEGs火山圖。紅色（上調(diào)）/綠色（下調(diào)）。
（E）基因本體（GO）分析顯示DEGs在某些生物學(xué)過程、分子功能和細(xì)胞組分中富集。
參考文獻(xiàn)：
Chen, F.; Li, M.-G.; Hua, Z.-D.; Ren, H.-Y.; Gu, H.; Luo, A.-F.; Zhou, C.-F.; Zhu, Z.; Huang, T.; Bi, Y.-Z. TET Family Members Are Integral to Porcine Oocyte Maturation and Parthenogenetic Pre-Implantation Embryogenesis. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 12455. https://doi.org/10.3390/ijms241512455.
單細(xì)胞組學(xué)技術(shù)為探明哺乳動物卵母細(xì)胞早期生長分子機制提供了新機遇。此前，單細(xì)胞DNA甲基化（scBS-seq）與轉(zhuǎn)錄組測序（Smart-seq2）已揭示豬生發(fā)泡卵母細(xì)胞成熟的關(guān)鍵調(diào)控機制，闡明了減數(shù)分裂停止到恢復(fù)的分子過程（詳見：項目文章 | 單細(xì)胞DNA甲基化與轉(zhuǎn)錄組分析揭示豬生發(fā)泡卵母細(xì)胞成熟的關(guān)鍵調(diào)控機制）。TET家族酶在基因組去甲基化中扮演重要角色，對胚胎發(fā)育和干細(xì)胞多能性至關(guān)重要，但在豬卵母細(xì)胞中的具體功能仍需深入探究。
本研究發(fā)現(xiàn)TET家族酶（TET1、TET2、TET3）在豬卵母細(xì)胞成熟和孤雌胚胎發(fā)育中發(fā)揮關(guān)鍵作用。Bobcat339處理通過改變5mC和5hmC水平，顯著影響卵母細(xì)胞成熟、紡錘體結(jié)構(gòu)、染色體排列及胚胎發(fā)育進(jìn)程。此外，TET酶還通過調(diào)控合子基因組激活（ZGA）及多能性相關(guān)基因的表達(dá)，進(jìn)一步影響胚胎發(fā)育。這些發(fā)現(xiàn)為理解TET家族在哺乳動物胚胎發(fā)育中的功能提供了新視角。
Smart-seq2技術(shù)是本研究的核心支持，其高通量轉(zhuǎn)錄組分析揭示了Bobcat339處理后胚胎的差異表達(dá)基因及發(fā)育停滯的分子機制。該技術(shù)為深入理解胚胎發(fā)育分子過程提供了重要線索和數(shù)據(jù)支持，為后續(xù)基因功能驗證及豬生殖生物學(xué)和胚胎工程研究奠定了堅實的理論基礎(chǔ)。
研究摘要
近日，湖北省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所陳礬博士（助理研究員）為第一作者，黃濤副研究員和畢延震研究員為共同通訊，在《International Journal of Molecular Sciences》（Int. J. Mol. Sci. ）期刊發(fā)表題為《TET Family Members Are Integral to Porcine Oocyte Maturation and Parthenogenetic Pre-Implantation Embryogenesis》的科研成果。研究通過使用Bobcat339（一種特異性的小分子TET家族抑制劑）處理以抑制TET酶活性，進(jìn)而觀察其對豬卵母細(xì)胞成熟和早期胚胎發(fā)育的影響。研究結(jié)果揭示了TET家族酶在調(diào)控豬卵母細(xì)胞成熟、紡錘體結(jié)構(gòu)、染色體排列以及胚胎發(fā)育過程中5mC和5hmC水平的關(guān)鍵作用。研究闡明了TET酶在豬卵母細(xì)胞成熟和孤雌胚胎發(fā)育中的具體作用機制，為理解哺乳動物胚胎發(fā)育的表觀遺傳調(diào)控提供新的視角。此外研究結(jié)果也為豬的生殖生物學(xué)和胚胎工程提供重要理論基礎(chǔ)，有助于優(yōu)化豬的繁殖技術(shù)和胚胎發(fā)育調(diào)控策略。
標(biāo)題：TET Family Members Are Integral to Porcine Oocyte Maturation and Parthenogenetic Pre-Implantation Embryogenesis（TET家族成員對豬卵母細(xì)胞成熟和孤雌胚胎發(fā)育至關(guān)重要）
發(fā)表時間：2023-08-05
發(fā)表期刊：Int. J. Mol. Sci.
影響因子：IF 5.6/Q2
技術(shù)平臺：Smart-seq2等
研究方法
樣本收集：從雌豬卵巢中分離3-6 mm的卵泡，收集帶有均勻細(xì)胞質(zhì)和多層卵丘細(xì)胞的卵丘卵母細(xì)胞復(fù)合體（cumulus oocyte complexes, COCs）。
體外成熟（IVM）：將COCs在培養(yǎng)基中培養(yǎng)，添加促性腺激素（eCG和hCG）以促進(jìn)卵母細(xì)胞成熟。
孤雌激活：去除卵丘細(xì)胞后，激活卵母細(xì)胞，激活后的卵母細(xì)胞在培養(yǎng)基中培養(yǎng)。
Bobcat339處理：將Bobcat339溶解于DMSO中，稀釋至不同濃度（0μM、50μM、100μM、200μM、400μM），添加到成熟培養(yǎng)基中以抑制TET酶活性。
檢測方法：
免疫熒光染色：檢測5mC和5hmC水平。
qRT-PCR：用于檢測基因表達(dá)水平。
微量RNA測序（Smart-seq2）：分析胚胎轉(zhuǎn)錄組的變化。
結(jié)果圖形
（1）Bobcat339處理阻斷豬卵母細(xì)胞第一極體（First Polar Body）排出
實驗中，不同濃度的Bobcat339處理顯著降低了豬卵母細(xì)胞第一極體排出率（PBE），表現(xiàn)為濃度依賴性。在200μM和400μM濃度下，PBE率顯著下降，表明Bobcat339抑制TET酶活性后，卵母細(xì)胞成熟過程受到阻礙。
圖1：Bobcat339處理抑制了豬卵母細(xì)胞成熟。
（A）對照組和經(jīng)Bobcat339處理（0、100、200和400 μM）的卵丘卵母細(xì)胞復(fù)合體（COCs）在體外培養(yǎng)24、36和44小時后的代表性圖像。對照組的卵丘細(xì)胞擴張良好，而Bobcat339處理組的卵丘細(xì)胞擴張較少且更加黏附。（B）經(jīng)100μM、200μM和400μM Bobcat339處理后，第一極體排出（PBE）率顯著降低。
（C）對照組和經(jīng)200μM Bobcat339處理的卵母細(xì)胞在體外培養(yǎng)44小時后的第一極體排出的代表性圖像。
（2）經(jīng)Bobcat339處理引發(fā)豬卵母細(xì)胞凋亡
通過Annexin-V-FITC染色檢測早期凋亡水平，發(fā)現(xiàn)Bobcat339處理后的卵母細(xì)胞早期凋亡率顯著增加。此外，BAX和BCL-2的mRNA水平顯著升高，BAX/BCL-2比值顯著上升，表明TET酶抑制導(dǎo)致卵母細(xì)胞早期凋亡。
圖2：Bobcat339處理誘導(dǎo)豬卵母細(xì)胞早期凋亡。
（A）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞的早期凋亡熒光信號。（B）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中帶有Annexin-V信號的卵母細(xì)胞比例。
（C）qRT-PCR檢測對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞BAX、BCL-2、BAX/BCL-2的mRNA水平。
（3）Bobcat339對卵母細(xì)胞紡錘體結(jié)構(gòu)和染色體排列的作用
使用α-tubulin染色觀察紡錘體形態(tài)，結(jié)果顯示Bobcat339處理的卵母細(xì)胞紡中錘體結(jié)構(gòu)異常，染色體排列分散。與對照組相比，異常紡錘體和染色體排列比例顯著增加，表明TET酶對卵母細(xì)胞的紡錘體結(jié)構(gòu)和染色體排列具有重要作用。
圖3：Bobcat339對紡錘體形態(tài)和染色體排列的影響。
（A）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞（200μM Bobcat339）的紡錘體形態(tài)和染色體排列圖像。（B）經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中異常紡錘體比例顯著增加。
（C）經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中染色體錯位比例顯著升高。
（4）Bobcat339處理導(dǎo)致豬卵母細(xì)胞中的5mC/5hmC水平發(fā)生變化
免疫熒光染色結(jié)果顯示，Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中5hmC信號顯著降低，而5mC信號顯著增加。定量分析進(jìn)一步驗證這一結(jié)果，表明TET酶通過調(diào)節(jié)5mC和5hmC水平影響卵母細(xì)胞成熟。
圖4：Bobcat339處理改變了豬卵母細(xì)胞中的5mC和5hmC水平。
（A）豬卵母細(xì)胞中5hmC的免疫熒光染色。（B）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中5hmC的熒光強度。
（C）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中5mC的免疫熒光染色。
（D）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的卵母細(xì)胞中5mC的平均熒光強度。
（5）Bobcat339對胚胎發(fā)育的影響
在孤雌胚胎發(fā)育實驗中，不同濃度的Bobcat339處理顯著降低了胚胎發(fā)育到囊胚階段的比例。胚胎在4細(xì)胞階段停滯，表明Bobcat339抑制TET酶活性后，胚胎發(fā)育受到嚴(yán)重影響。
圖5：Bobcat339處理抑制了豬的早期胚胎發(fā)育。
（B）對照組和經(jīng)Bobcat339處理組中發(fā)育到囊胚階段的激活卵母細(xì)胞比例。
（C）對照組和經(jīng)Bobcat339處理（25、50和100 μM Bobcat339）組中第3天不同階段的胚胎比例。
（6）Bobcat339處理降低了ZGA和多能性相關(guān)基因的表達(dá)
qRT-PCR檢測結(jié)果顯示，Bobcat339處理后，合子基因組激活（zygotic gene activation，ZGA）標(biāo)記基因（如EIF1A和DPPA2）以及多能性相關(guān)基因（如OCT4和NANOG）的mRNA水平顯著下降，表明Bobcat339處理破壞了ZGA，影響胚胎發(fā)育。
圖6：Bobcat339處理阻斷了ZGA和多能性基因的表達(dá)。
（B）經(jīng)Bobcat339處理的胚胎中，OCT4和NANOG的mRNA水平降低；SOX2的mRNA水平則沒有變化。
（C）Bobcat339處理后，H19的mRNA水平未受影響。
（7）Bobcat339處理影響豬胚胎中的5mC/5hmC水平
免疫熒光染色和定量分析顯示，Bobcat339處理的胚胎中5hmC水平顯著降低，而5mC水平顯著增加，表明TET家族酶通過調(diào)節(jié)5mC和5hmC水平影響胚胎發(fā)育。
圖7：Bobcat339處理影響豬胚胎中的5mC和5hmC水平。
（C-D） 對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎在2細(xì)胞和4細(xì)胞階段的5mC免疫熒光染色。
（E-F） 在對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎中，2細(xì)胞和4細(xì)胞階段的5hmC熒光強度。
（G-H） 在對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎中，2細(xì)胞和4細(xì)胞階段的5mC平均熒光強度。
（8）微量轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的比較分析
通過Smart-seq2技術(shù)對4細(xì)胞階段的胚胎進(jìn)行RNA測序分析，分析結(jié)果鑒定出Bobcat339處理后胚胎中的203個差異表達(dá)基因（DEGs），其中75個上調(diào)基因，128個下調(diào)基因。基因本體（GO）分析顯示，這些差異表達(dá)基因主要富集在細(xì)胞增殖、細(xì)胞組分與線粒體相關(guān)以及細(xì)胞黏附分子結(jié)合等生物學(xué)過程中。
圖8：對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎之間的差異基因表達(dá)模式。
（B）對照組和經(jīng)Bobcat339處理組之間的基因表達(dá)和分布的小提琴圖。
（C）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎在4細(xì)胞階段的差異表達(dá)基因（DEGs）的分層聚類。
（D）對照組和經(jīng)Bobcat339處理的胚胎在4細(xì)胞階段DEGs火山圖。紅色（上調(diào)）/綠色（下調(diào)）。
（E）基因本體（GO）分析顯示DEGs在某些生物學(xué)過程、分子功能和細(xì)胞組分中富集。
參考文獻(xiàn)：
Chen, F.; Li, M.-G.; Hua, Z.-D.; Ren, H.-Y.; Gu, H.; Luo, A.-F.; Zhou, C.-F.; Zhu, Z.; Huang, T.; Bi, Y.-Z. TET Family Members Are Integral to Porcine Oocyte Maturation and Parthenogenetic Pre-Implantation Embryogenesis. Int. J. Mol. Sci. 2023, 24, 12455. https://doi.org/10.3390/ijms241512455.
標(biāo)簽：
DNA甲基化
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- ChIP-seq揭示組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶NSD2在炎癥性腸病發(fā)生過程中的表觀調(diào)控
- 微量轉(zhuǎn)錄組測序揭示TET酶在動物卵母細(xì)胞成熟和孤雌胚胎發(fā)育中的作用
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