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揭開冠狀病毒疾病的神秘面紗-肽-脂膜相互作用結構功能分析的應用

瀏覽次數:1738 發布日期:2020-7-16  來源:本站 僅供參考,謝絕轉載,否則責任自負
 
迄今為止,已有7種已知的冠狀病毒會導致人體疾病,其中的4種只會導致輕型或中型疾病。在過去的20年里,其余3種冠狀病毒逐漸出現在動物宿主身上,并且在全球范圍內引起疫情,導致嚴重的呼吸道疾病甚至許多死亡案例。2002年爆發的嚴重急性呼吸綜合征(SARS)是由SARS冠狀病毒(SARS-CoV)引起的;而在2012年,中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV)被發現,并持續導致疫情偶發和局部爆發。
 
最近感染到人類的冠狀病毒是嚴重急性呼吸綜合征冠狀病毒2型(SARS-CoV-2),它于2019年12月在中國被首次報道,隨后在2020年3月被世界衛生組織(WHO)確認為全球大流行病。這種病毒導致的疾病被稱為COVID-2019,也就是一種呼吸道疾病,可導致輕微的流感樣癥狀甚至致命的肺部疾病。
 
 
冠狀病毒對我們有哪些影響?
 
病毒想要感染一個活的有機體,就必須要侵入其細胞,然后繁殖并持續感染其他宿主。病毒的類型決定哪些細胞會受到影響,冠狀病毒主要攻擊呼吸系統的細胞。隨著SARS 和MERS 的爆發,以及最近的新冠肺炎病毒,研究人員一直致力于研究這些病毒是如何進入我們的細胞的,并希望能夠找到一種預防方法。
 
當冠狀病毒進入人體時,它們必須和宿主細胞的脂膜融合,然后才能傳遞他們的遺傳物質。目前我們還不是很清楚融合的機制,但是已知的是,一種在結構上被歸類為I 類病毒融合蛋白,并和流感病毒與艾滋病病毒在同一組的S 蛋白,會推動病毒結合并入侵細胞。S 蛋白的蛋白質剪切揭示出,是它的融合肽(FP)發起了膜融合。作為冠狀病毒攻擊細胞的重要組成部分,定位和表征FP 是研究小組的優先任務,但是它的確切位置一直都存在爭議。
 
 
重要的分析工具

研究人員用來定位冠狀病毒FP 的一種技術是電子順磁共振(EPR)波譜。EPR可以用于識別和定量固體、液體、氣體、細胞和體內的順磁性物質(自由基和過渡金屬離子)。因此,EPR 是一種很普遍的分析方法,適用于從納米金剛石到細胞膜等一系列的應用。
 
有一項研究使用EPR 技術(ELEXSYS,   Bruker)對SARS 病毒FP 的肽-脂膜相互作用進行結構和功能分析。該研究模擬了從SARS冠狀病毒分離出來的不同肽與合成脂膜的結合,也就是多層膜泡(MLVs)。多層膜泡通過一種特殊的,叫做自旋標記的氮氧化物被標記,它對局部環境十分敏感。使用膜序作為參數,可以從肽混合物中識別出FP,因為這會導致EPR 譜線線寬和線型的變化。使用EPR技術,研究小組可以識別并表征SARS 冠狀病毒的FP。
 
之所以選擇SARS 冠狀病毒作為模型,是因為我們有大量可用的功能性數據。但是FP 在冠狀病毒家族里廣泛存在,所以此項研究的發現適用于所有的此類病毒,包括MERS 和任何在動物宿主身上爆發的新型病毒,比如新冠病毒。類似的研究繼續加深我們對冠狀病毒如何感染人體的理解,并且有助于實現防止這些病毒傳播的最終目標。
 
 
參考文獻:
1. Lai AL, Millet JK, Daniel S, Freed JH and Whittaker GR (2017) The SARS-CoV Fusion Peptide Forms an Extended Bipartite Fusion Platform that Perturbs Membrane Order in a Calcium-Dependent Manner, J Mol Biol, 8;429(24):3875-3892.
 
 
致謝

配圖來自 David S. Goodsell, RCSB Protein Data   Bank; doi: 10.2210/rcsb_pdb/goodsell-gallery-019
配圖描繪了一種剛剛進入肺部的冠狀病毒,它被呼吸細胞分泌的黏液、抗體和一些小的免疫系統蛋白所包圍。病毒被一層細胞膜所包圍,這層膜包含促進抓附和進入細胞的S 蛋白,參與細胞內核蛋白組織的M 蛋白,以及作為細胞膜通道的E 蛋白,它參與病毒出芽并有可能在這一過程中并入病毒顆粒。其中的核蛋白包括許多與基因組RNA 結合的N 蛋白副本。
 
 
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