基于成像的空間原位單細(xì)胞技術(shù)由于然受到光譜重疊、熒光團(tuán)可用性以及光學(xué)擁擠環(huán)境中信噪比的影響,RNA檢測(cè)往往面臨著顯著的靶標(biāo)數(shù)限制。CosMx WTx (CosMxTM Human Whole Transcriptome Panel;~19000-plex RNA)技術(shù)突破通量限制,實(shí)現(xiàn)超高分辨率+空間原位+全轉(zhuǎn)錄組檢測(cè),以超多重檢測(cè)能力、亞細(xì)胞級(jí)空間定位和單分子靈敏度,重新定義RNA分析的極限,為生命科學(xué)研究帶來革命性突破!
CosMx WTx已在包括極具挑戰(zhàn)性FFPE在內(nèi)的多種樣本類型中得到驗(yàn)證,目前已正式開放預(yù)訂。
獨(dú)特的探針設(shè)計(jì)和化學(xué)結(jié)構(gòu),在FFPE樣本中實(shí)現(xiàn)更高的細(xì)胞和轉(zhuǎn)錄本檢出率
CosMx WTx檢測(cè)試劑盒探針原位雜交探針設(shè)計(jì)基本包含了全部人類蛋白編碼基因( 占HUGO所注釋的蛋白編碼基因的99.5%以上)。捕獲序列的選擇遵循了嚴(yán)謹(jǐn)?shù)牡O(shè)計(jì)過程,保證了探針針對(duì)靶標(biāo)的特異性,同時(shí)在RNA分子高度片段化的FFPE組織中也能實(shí)現(xiàn)高檢測(cè)靈敏度。
穩(wěn)定高效的原位雜交循環(huán)成像化學(xué)原理
(1)可實(shí)現(xiàn)高信噪比(SNR)檢測(cè),精準(zhǔn)識(shí)別單個(gè)熒光信號(hào)點(diǎn);
(2)通過紫外線(UV)可以快速、溫和地淬滅熒光信號(hào);
(3) 在工業(yè)生產(chǎn)過程中嚴(yán)格控制,確保每個(gè)檢測(cè)轉(zhuǎn)錄本的原位成像具有相同的光斑大小和熒光強(qiáng)度。
高分辨率的大數(shù)據(jù)輸出
CosMx WTx利用先進(jìn)的光學(xué)系統(tǒng)和低體積微流體技術(shù),能夠高效地實(shí)現(xiàn)對(duì)數(shù)百萬個(gè)細(xì)胞進(jìn)行分析,獲得全面的空間信息。
自適應(yīng)解碼算法提高數(shù)據(jù)質(zhì)量
CosMx WTx采用了先進(jìn)的自適應(yīng)解碼算法,通過動(dòng)態(tài)調(diào)整最大限度地捕獲轉(zhuǎn)錄本和最小化非特異性信號(hào),為轉(zhuǎn)錄本計(jì)數(shù)提供了更高的可信度,實(shí)現(xiàn)更精確的單細(xì)胞分析。
廣泛適用于多種組織類型
已證明可廣泛適用于各種組織類型,例如不同類型腫瘤組織、腦組織、皮膚等,同時(shí)兼容蠟塊、FFPE組織切片、新鮮冷凍樣本等多種樣本類型送樣。
高動(dòng)態(tài)范圍和全面的轉(zhuǎn)錄本檢測(cè)
以下是官方驗(yàn)證CosMx WTX在FFPE樣本中的檢測(cè)能力和性能表現(xiàn):對(duì)六種不同的人類組織類型(結(jié)腸、胰腺、海馬、皮膚、乳腺、腎臟)的5μm FFPE切片進(jìn)行檢測(cè),每個(gè)樣本(約1cm2檢測(cè)面積)能夠獲得30萬~60萬個(gè)具有空間背景的單細(xì)胞,六種組織類型檢測(cè)基因數(shù)在8,392-15,960之間,每個(gè)細(xì)胞檢測(cè)到約1,556個(gè)轉(zhuǎn)錄本(中位數(shù))。
官方數(shù)據(jù)展示
精準(zhǔn)的細(xì)胞分割算法
CosMx SMI的細(xì)胞分割方法結(jié)合了細(xì)胞核、細(xì)胞體、細(xì)胞膜等多種高分辨率細(xì)胞形態(tài)成像信息和數(shù)據(jù)驅(qū)動(dòng)的機(jī)器學(xué)習(xí)算法,從而獲得精準(zhǔn)的單細(xì)胞邊界界定。
官方數(shù)據(jù)展示
CosMx WTx空間單細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄檢測(cè)技術(shù)是空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)重要里程碑,其建立在循環(huán)原位雜交化學(xué)的基礎(chǔ)上,通過原位成像實(shí)現(xiàn)了超高分辨率覆蓋全轉(zhuǎn)錄組檢測(cè),解決了基于成像的單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)通量上的局限,支持研究人員全面地了解完整組織環(huán)境中的細(xì)胞及分子機(jī)制,從而為生物發(fā)現(xiàn)和治療干預(yù)提供新的見解。
尖端生命科學(xué)與生物醫(yī)藥創(chuàng)新技術(shù)服務(wù)中心(CITC)-SBC服務(wù)平臺(tái)部深耕組學(xué)研究20年,無論是芯片還是測(cè)序,單細(xì)胞亦或是空間組學(xué),經(jīng)驗(yàn)豐富的我們與“芯空一號(hào)”,讓您的生命科學(xué)研究更上一層樓。歡迎各位老師前來咨詢!