【課程內容】
1.零基礎全面掌握生信核心知識點；
2.零基礎學會SCI模塊化寫作思路和修稿策略；
3.極速寫一篇SCI論文的核心思維和實操步驟；
4.零基礎極速掌握R語言核心知識點。
5.百分百的售后，一次授課，終生答疑。
【授課老師】
百川，百川科研公眾號創建者，211/985大學教授，發表SCI文章50余篇，數家SCI雜志審稿人，資深職業寫手，擅長SCI文章撰寫與修稿，具有多年生信培訓經驗，學員反響熱烈。本次將傾情奉獻，從構文思路、到實操步驟、到寫作指導、到投稿修稿，提供一站式指導，課程緊緊圍繞差異分析、泛癌分析、多組學分析、多芯片聯合分析、批量生存分析、信號通路的篩選、蛋白互作、免疫微環境、ceRNA網絡、單細胞測序、實驗關鍵基因的篩選、基因Signature的篩選、預測模型的建立、預測模型的評價、LASSO回歸、Nomogram諾模圖、ROC曲線、以及最新的熱點（課上內容）等等進行抽吸剝繭的精講，現場指導寫作，課程結束當天能夠寫成自己的文章初稿。
【課程目標】
（1）沒有課題時，自己找到課題；沒有機制時，自己找到機制；
（2）讓自己SCI文章或國自然項目內容更夯實，思路邏輯更完美；
（3）思路缺乏創新性，怎么辦？老師給你最新的生信分析熱點；
（4）掌握R語言的核心技能，掌握批量分析方法，掌握頂層計算機思維體系；
（5）掌握生信SCI寫作思路和修稿思路；
（6）掌握生信分析的獨家套路（5個套路供你選擇）；
【課程內生信核心內容】
（1）配對/多組差異分析；（2）蛋白質相互作用網絡;(3) 免疫微環境；（4）ceRNA網絡構建；（5）細胞焦亡的分析流程；（6）批量生存分析;(7)預測模型的建立及評價；（8）Cytoscape軟件精講；（9）實驗基因的尋找與生信驗證；（10）單基因泛癌分析；（11）多組學分析；（12）多芯片聯合分析；（13）實驗信號通路的篩選；（14）基因Signature的構建；（15）生信預測模型的建立；（16）預測模型的評價；（17）Cox回歸；（18）LASSO回歸；（19）Nomogram諾模圖（20）ROC曲線；（21）單細胞測序核心知識點；（22）單細胞測序數據的整理；（23）單細胞測序數據的質控；（24）降維分析；（25）聚類分析；（26）單細胞測序細胞亞群的區分；（27）單細胞測序數據的差異分析；（28）單細胞測序細胞群的注釋；（29）新的細胞亞群的鑒定；（30）如何結合生信熱點發前沿文章。
【課程安排】

日期	課程主要內容
第1天 19:30-22:30	R語言基礎知識介紹；R語言讀入及讀出； R包的多種安裝模式； R包及bioconductor資源的使用； R語言數據框的操作； R語言數據結構及循環控制（向量、因子、矩陣、數據庫、列表、for循環、if控制）； DIY自己的人生第一個批量處理函數； R語言繪圖原理及體系；R語言基本繪圖和高級繪圖精講及實操； GEO數據庫介紹、下載、清洗和探針注釋；TCGA數據的下載、清洗、不同類型數據的轉換
第2天 19:30-22:30	多個GEO芯片聯合分析的多種思路； GEO芯片的probe探針的轉化方法匯總 差異分析精講（從表達矩陣的整理、歸一化、標準化到差異分析、多組差異分析、配對差異分析） 差異基因的呈現（精美火山圖、熱圖、PCA圖、小提琴圖） GEO數據的處理流程演示及學員實戰（數據清洗、熱圖、火山圖、GO分析、KEGG分析、共表達分析） R語言實現生存分析、功能注釋（精美生存曲線圖） GSEA講解及結果解讀（精美GSEA圖）
第3天 19:30-22:30	GSEA分析的全套流程講解及結果的詮釋（精美GSEA圖） 兩個基因相關性分析； 單基因生存分析 多基因生存分析 任意癌癥任意基因在癌和癌旁的表達分析； 同一癌癥不同亞型和不同分期的表達分析； 單基因在多個正常組織中的表達分析； 單基因在多個癌組織中的表達分析； 單基因在多個癌和癌旁中的表達分析； 預后模型類思路和實操精講：基因Signature的構建；生信預測模型的建立；預測模型的評價； Cox回歸； LASSO回歸； Nomogram諾模圖；ROC曲線。
第4天 19:30-22:30	蛋白互作網絡構建、cytoscape的實操使用，MCODE的實操； cytoHubba實操選取Hub genes(精美蛋白互作圖) 多個GEO數據的分析思維及實操 ceRNA的理論講解 mRNA incRNA miRNA的獲取。ceRNA網絡構建，ceRNA網絡的驗證 ceRNA網絡的展示（發表極分子網絡） 免疫微環境的理論講解，免疫浸潤實操：自己測序樣本中免疫浸潤 細胞豐度的計算；單基因表達與免疫細胞的影響、單基因突變與免疫細胞的影響、單基因拷貝數對免疫細胞的影響，免疫浸潤細胞與臨床因素的關系 單基因泛癌分析、泛癌表達量分析、泛癌生存分析 泛癌基因突變 泛癌免疫分析； 多組學分析；
第5天 19:30-22:30	單細胞測序的分析思路及操作流程(單細胞測序核心知識點；單細胞測序數據的整理；單細胞測序數據的質控；降維分析；聚類分析；單細胞測序細胞亞群的區分；單細胞測序數據的差異分析；單細胞測序細胞群的注釋；新的細胞亞群的鑒定) 生信的其他應用(怎么利用TCGA/GEO數據庫中找課題?怎么利用TCGA/GEO挖掘下游機制？如何利用TCGA/GEO數據庫申請國自然？如何利用TCGA/GEO數據庫發表文章？) 最新熱點的分析思路指導(如何結合生信熱點發前沿文章) SCI文章模塊化寫作精講和修稿策略，實例講解：審稿人讓補充實驗，如何不做實驗也能讓審稿人滿意。 實戰環節：每個分析步驟的一步一步，“我在講，你在做，不懂你就問”的DIY環節；

 【涉及的31個議題】
1，沒有課題時，如何找課題、找線索、找機制？
2，后續細胞實驗，如何精準找到下游作用通路或因子？
3，花錢測序回來的一堆結果，亂七八糟，怎么梳理、再分析成一篇SCI論文？
4，gene signature類文章的一些禁忌，哪些是評審專家特別看重，一票否決的點？
5，當下熱門的免疫微環境是怎么回事，怎么利用自己的數據進行操作?
6，審稿人說只有生信分析，沒有實驗驗證，怎么辦？,
7, TCGA數據庫中的數據，怎么下載，需要進行哪些數據清洗？
8，文章寫好了，怎么選刊，避免踩雷？
9，WGCNA是什么東西，為什么是生信分析的神器？
10，生存分析有幾種方案？怎么進行批量操作？
11，免疫浸潤的計算方法有多少種，怎么多種方法批量分析？
12，目前有什么熱點，怎么結合熱點，發出不一樣的生信文章？
13，單基因生信分析，能做到什么程度?
14，兩個基因，能進行什么生信分析，產生多少結果用于SCI文章中？
15，一群基因，能進行什么生信分析，產生多少結果用于SCI文章中？
16，如何利用生信挖掘，沒有試驗前期，也能寫課題中標書？
17，差異表達分析怎么做、配對樣本怎么做，多組樣本怎么做，小樣本怎么做，大樣本怎么做？
18，GSEA基因集富集分析，優點是什么，缺點是什么，怎么做？CNS的大牛文章中到底是怎么用GSEA的？怎么在文章或課題里利用GSEA加分？
19，ceRNA網絡怎么構建? 對于mRNA，miRNA，lncRNA，cirRNA，我們應該做些什么？
20，GE0芯片數據，除了熱圖、火山圖，還能做什么？
21，那么多GEO平臺，如何以不變應萬變的進行探針ID轉換？
22，GEO多芯片數據，如何進行批次效應的處理？
23，ssGSEA算是批次效應的終結者嗎？批次效應的終結者到底是什么？
24，如何對長鏈非編碼RNA、假基因等一網打盡的注釋？
25，單基因GSEA怎么做？有什么用途？跑出的結果怎么挑選和分析？
26，TCGA數據的正常和癌組織怎么分組，轉移和未轉移怎么分組，配對樣本怎么挑選？
27，如何從TCGA數據中提取出lncRNA？
28，同一基因出現不同的分析結果，我該信誰？
29，做通路分析時，肺癌的數據聚類出肝癌的通路，這是怎么回事？
30，我想進一步學習，但害怕四處折騰踩雷，有什么避雷指南?
31，別人生信學3個月或學半年，我怎么學，才能后來居上，超過他們？
 
【主辦單位】
瑋瑜科研平臺（上海瑋瑜生物科技有限公司）
【承辦單位】
上海瑋瑜生物科技有限公司
上海焦務科技服務中心
【培訓時間】
2022年1月3日-7日晚上
【注冊費用】
注冊費用：3200元/人
可開會務、注冊、檢測、分析服務等發票
【繳費賬號】
A：匯款賬戶
戶 名：上海焦務科技服務中心  
賬戶號：9734 0078 8012 0000 0311
開 戶 行：上海浦東發展銀行大華支行 
B：支付寶轉賬
收款人：wybiot@163.com   支付寶戶名:上海瑋瑜生物科技有限公司
C：信用卡或公務卡支付
微信或支付寶掃描二維碼支付，通過信用卡/公務卡扣款
【聯系人】
聯系人：謝老師 13611825136     
報名郵箱：wybiot@126.com

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