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講座:基于深度學習DIA數據分析及腫瘤新生抗原發現

瀏覽次數:4779 發布日期:2021-9-14  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處

金秋九月,豆谷科技將聯合BSI于2021年9月28日推出基于PEAKS Online高靈敏度高通量的DIA完整數據分析及腫瘤新生抗原解決方案的免費在線講座。由高級應用工程師李文婷為大家介紹PEAKS Online的軟件平臺,并由BSI的單寶珍博士和大家一起探討AI賦能腫瘤新生抗原發現解決方案。期待各位同行,老師和同學們參與!
 

講座內容:
 

一、PEAKS Online基于深度學習的DIA完整工作流

時間:2021年9月28日14:30-15:10



主講人:李文婷(高級應用工程師)
 

 

二、AI賦能腫瘤新生抗原發現

時間:2021年9月28日15:10-15:50
 


主講人:單寶珍 博士,CEO & CSO
 

講座背景介紹:

基于質譜的蛋白質組學數據采集方式已從數據依賴性采集(DDA)走向數據非依賴性采集(DIA),這主要是由于DIA可為用戶提供額外的豐富信息。然而,一直以來,DIA數據的處理分析仍然具有挑戰性。比如,搜索這些數據通常需要一個巨大的譜圖庫,而這個譜圖庫是由DDA模式下運行的高度分餾的樣本產生的,這實際上與DIA的目的是不相符的。基于深度學習的譜圖預測模型的最新進展使得通過預測譜圖和保留時間來進行數據庫搜索成為可能,并且深度學習還可以對DIA數據進行多肽從頭測序,從而鑒定出ORFs以外的多肽。今年BSI開發推出了PEAKS Online的DIA全工作流,集成譜圖庫搜索、數據庫搜索及多肽從頭測序,實現可以對DIA和DDA數據進行準確全面分析的高通量處理。對多肽的鑒定和定量具有超高的靈敏度和準確度。以免疫多肽組分析為例,PEAKS Online 對免疫多肽組的DIA數據分析,僅僅在譜圖庫搜索的結果,HLA-bound peptide的鑒定結果比之前文獻報道的多約50-200%。并且,通過不同方法對HLA-bound peptide的結合基序分析,都表現出非常高的特異性。
 

如何報名:
 

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關于豆谷科技

上海豆谷信息科技有限公司是一家致力于為蛋白質組學和抗體生物藥領域的科研工作者提供基于質譜的數據分析軟件和服務整體解決方案的公司,是加拿大Bioinformatics Solutions Inc在中國的獨家代理,負責軟件全系列產品和服務的商務、銷售和技術工作,主要包括:PEAKS AB及抗體測序與表征服務,PEAKS Studio、PEAKS Online等


關于BSI

BSI是世界領先的生物信息軟件和服務公司,位于加拿大享有“硅谷”之稱的安大略省滑鐵盧市。BSI在質譜數據分析領域擁有多年的經驗積累,為迅猛發展的基因組學,蛋白質組學和生物技術行業提供了世界領先的算法和軟件解決方案及質譜分析服務。旗下著名的PEAKS軟件平臺在全世界范圍內擁有上千家學術和工業界用戶。2016年ASMS期間BSI又隆重推出的PEAKS AB軟件平臺更是一經推出即獲得多家生物制藥公司的青睞。

相關公司:上海豆谷信息科技有限公司
聯系電話:021-54155562
E-mail:sales@wandougu.com


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