生物數據分析技能2.0實訓會通知
瀏覽次數:5812 發布日期:2019-12-13
來源:本站 本站原創,轉載請注明出處
生物醫學已進入大數據時代,借助生物醫學多組學、多層次的海量數據,可以從前所未有的廣度和深度來研究生物體運行機制。由于生物醫學數據多呈分散復雜特征,以海量數據挖掘與分析為主體內容的生物信息學技能就成為科研必要手段,如疾病的病因學、臨床診斷標志物、治療或作用靶點識別,關鍵大分子的發現與功能預測,以及遺傳調控機制等方面。本課程曾先后用名《基因序列分析技術》和《功能基因組信息分析技術》,后將上述兩門課程整合更名為《生物數據分析技能》,此前共計舉辦了21期。自本期會議起,會議升級為《生物數據分析技能2.0》,對課程內容與培訓日程進行了大幅度調整,遞進式專注講解高通量數據解析:表達數據挖掘→共表達(聚類、富集、相互作用)分析→構建調控網絡,以順應學科發展和滿足學員實際需要。授課繼續沿用主講教師獨創的TPS(Teaching-Practicing-Showing)教學模式,著力于以真實問題為引線,將理論授課與上機實踐有機地融為一體,逐步介紹涉及的各項技能,指導學員將其融會貫通并應用到課題研究中。TPS教學模式多年來在本科、研究生教學及20余期各類培訓會議中取得了極佳的教學效果,受到廣大學員的一致好評和推崇。
時間地點:
2020年1月10日-12日(周五-周日)(周五報到,周六-周日授課兩天一夜)
合肥伯爵世家酒店(合肥市瑤海區北二環雙七路156號)
主辦單位:
北京華斯泰生物醫學科技有限公司
培訓日程:(所有課程均含上機實踐)
日期 |
時間 |
授課題目 |
授課內容 |
1月10日 |
16:00-21:00 |
培訓簽到-領取資料 |
|
1月11日 |
08:00-08:30 |
軟件安裝,調試運行 |
|
08:30-10:30 |
表達譜差異數據挖掘 |
差異表達基因集(DEGs)分析策略。
GEO數據庫檢索及數據集在線分析。
利用GEO2R在線工具篩選獲得差異表達基因集,并獲得TCGA數據庫交集結果。 |
10:30-12:00 |
表達譜數據聚類分析 |
利用ArrayTools軟件(設置各項參數)處理GEO數據庫下載的表達譜數據。
表達譜數據聚類分析。
聚類圖形優化工具。 |
14:00-17:30 |
基因集功能富集分析 |
利用DAVID、Metascape在線工具進行基因集功能富集分析(GO MF、GO BP、GO CC;KEGG Pathway)。
繪制或下載基因集功能富集圖。
基因集韋恩圖分析。
基因集ID多元轉換。 |
19:00-22:00 |
基因集相互作用分析 |
利用String在線工具(設置各項參數)獲得基因集相互作用結果。
mRNA-miRNA、miRNA-lncRNA、miRNA-circRNA、mRNA-circRNA相互作用分析。 |
1月12日 |
08:30-12:00 |
交互作用數據可視化 |
利用Cytoscape軟件進行基因注釋、分子間相互作用、基因集差異表達的可視化分析。
批量修改交互網絡的節點、邊、背景屬性。
利用Cytoscape App進行基因集交互網絡的GO富集分析、文本挖掘、關鍵/瓶頸基因及核心基因篩選。
高分辨率可視化結果的保存與輸出。 |
13:30-16:00 |
共表達調控網絡構建 |
構建基因集差異共表達Pathway/circRNA-mRNA-miRNA-lncRNA/circRNA調控網絡。
靶點基因分析策略。 |
具體事宜:
1. 培訓期間提供午餐、11日晚餐。住宿統一安排在合肥伯爵世家酒店(合肥站店),主辦單位可為學員代訂房間,標準間/單人間200元/間(含早餐),費用自理;學員也可自行上網預訂。住宿費發票在退房時由酒店開具。對于需要合住的學員,會務組將按報到先后順序安排,最后出現單人無法安排的情況,需要自補房間差價。
2. 上機實踐需自帶筆記本電腦(非上網本),會場將布置充足的電源插座。請確保電腦配置無線網卡(無線wifi覆蓋會場)。為提高上網效率,推薦自行攜帶4G無線上網卡或具有熱點共享功能的手機。操作系統為Win7/8/10 64位專業版(非任何商業版及Mac系統),辦公軟件為Office 2010以上專業版(非任何商業版及WPS Office),否則無法保證全部軟件順利安裝和使用。
3. 授課幻燈、軟件(附安裝指南)及上機實踐文檔已上傳至百度網盤,在報到通知中會告知鏈接及密碼。軟件請事先下載并安裝,如安裝有問題,請咨詢客服或開課當天到會場咨詢。
4. 嚴格按照培訓日程授課(共計22標準學時),第二天16:00結課,方便外地學員返程。
會議費用:
2019年12月20日前報名并繳費3200元/人,12月20日后3400元/人(5人及以上團體報名并實際報到另優惠300元/人),授課期間發放紙質邀請函(蓋章)和發票。
本次會議費委托合肥華斯泰生物醫學科技有限公司收取并統一提供會務發票。
1.網上匯款或銀行轉賬
戶 名:合肥華斯泰生物醫學科技有限公司
開戶行:中國銀行合肥臨泉路支行
帳 號:181246448304
2.支付寶賬號
名字:合肥華斯泰生物醫學科技有限公司
賬號:
kf@Huasitai.com 3.現場刷卡或現金
您也可以現場刷卡和支付現金?梢运⒐珓湛
注:匯款時請務必注明“生物數據”和學員姓名,匯款后將回單電子郵件發給我們,以便我們確認。
聯系方式: