羅氏與派瑪迪格攜手合作全面提升二代測序建庫自動化

瀏覽次數：3030　發(fā)布日期：2015-12-4　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉載請注明出處

高通量測序技術，又稱第二代測序技術（Next Generation Sequencing），使科學家可在一次實驗中對多個樣本進行多個基因的測序，并已成為現今遺傳基因研究領域中主流的實驗手段，對DNA和RNA樣本提供一個強大的檢測工具。在過去幾年，NGS技術不斷發(fā)展和改進以增加通量和降低成本。試劑廠家羅氏NimbleGen研發(fā)了SeqCapEZ目標序列捕獲試劑系列，它可以集中豐富人類核酸內的所有外顯子組或特定的基因片段，以減省分析數據時間和提高實驗效率。然而，這種目標序列捕獲和富集的手段往往需要大量秏時和費勁的樣本建庫預備，一般來說需要一位經驗豐富的技術人員花上最少4天去完成48個樣本建庫。由于二代測序對樣本有很高的要求，建庫過程中需要有經驗技術員高度專注去操作，包括建庫過程中樣本和試劑溫度的控制，孵育時間等等，稍有差池也會影響測序給果。

由于二代測序的樣本前處理和建庫的步驟繁復，很多實驗室想把這過程自動化，以確保準確性和實驗成功率。有見及此，NGS試劑廠家羅氏NimbelGen與法國移液工作站廠家PrimaDiag（派瑪迪格）共同在法國簽訂合作協(xié)議，在派瑪迪格的ACSIA工作站平臺上研發(fā)了NGSCapture系統(tǒng)來提供解決方案。ACSIA工作站擁有多個最新的技術，包括專利的自動磁化磁珠捕獲裝置、精準至0.1℃溫控系統(tǒng)、200rpm至3,000rpm范圍可調的振蕩器，使它可優(yōu)化所有磁珠法的實驗條件。而且，ACISA的操作軟件擁有專利的智能槍頭管理功能（Smart Tip），可自動計算槍頭使用數量和在沒有交叉感染的情況下重用槍頭，減省實驗成本。為了防止實驗受到外來的污染，ACSIA更可配備保護罩、紫外光燈和空氣過濾系統(tǒng)，提供全面的保護。

ACSIA工作站

經過優(yōu)化后，ACSIA工作站很完美地利用羅氏SeqCapEZ捕獲建庫試劑把整個二代測序的建庫過程自動化，與人手相比，ACSIA自動化平臺省卻了4小時的建庫時間，而且，在Smart Tip的功能下，所使用的槍頭比人手少了3倍，由原來的9盒槍頭減至3盒。在二代測序結果方面，ACSIA比人手操作帶來更穩(wěn)定和更好的測序效果！（見下圖）

二代測序檢測中，ACSIA（藍色）和人手（紅色）預備樣本中的18個基因組檢測覆蓋深度

ACSIA多功能工作站是全面的開放式平臺，系統(tǒng)已內置對各大試劑盒的優(yōu)化程序，如Illumina、Roche、Aligent、Kapa Biosystems，等。除了二代測序樣本制備外，ACSIA還可能進行移液分液、核酸提取及純化、PCR樣品制備、質譜樣本前處理、單針挑樣等實驗，實在是一臺多功能的自動化平臺！

派瑪迪格與羅氏合作新聞原稿：PARTNERSHIP WITH ROCHE DIAGNOSTICS FRANCE

更多參考信息：羅氏牽手派瑪迪格移液工作站進軍二代測序平臺

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