2015年5月22日，上海——2014年年初以來，在利比里亞、塞拉利昂和幾內亞等西非國家，埃博拉病毒殺死了超過10000人，造成近25000人受感染 。中國積極響應WHO（World Health Organization，世界衛生組織）呼吁，援助西非抗擊埃博拉疫情，派出公共衛生專家組前往疫區。

 

病原微生物生物安全國家重點實驗室童貽剛教授及其團隊在西非塞拉利昂抗擊埃博拉病毒的第一線，利用賽默飛Ion半導體測序系統對埃博拉病毒進行深度測序。測序工作具有非常重要的意義，通過測序可以確認流行的病毒株系，用以進行溯源分析和了解傳播路徑；由于現有實驗室診斷方法（定量PCR）、治療藥物與疫苗研發都與埃博拉病毒基因組序列密切相關，病毒基因突變可能導致定量PCR檢測時引物不匹配從而發生漏檢，也可能因為突變位點涉及藥物或者疫苗作用靶點而產生耐藥或者導致疫苗無效，因此通過測序了解病毒的變異對于病毒檢測及疫苗、藥物的研發都具有重要意義。

 

此次測序對從去年疫情高峰期9月至11月間收集的175個埃博拉病毒樣本進行全基因組序列測定。基于此次測序數據，確定目前在塞拉利昂流行的埃博拉病毒主要株系是由早前發表于《Science》文章中提出的三個主要的流行株中的第三分支進一步演變而產生。此外，此次測序也確認埃博拉病毒的突變速度并沒有加快。與之前《Science》測序數據相比，此次測序數據取樣時間跨度更長，樣本量更大，因此結果更為翔實可靠。

 

針對此次測序工作，童貽剛教授肯定了賽默飛Ion半導體測序平臺的測序速度具有非常明顯的優勢，能夠在24小時內完成從核酸提取到獲得測序結果的整個過程；教授同時贊賞半導體試劑具有非常好的性價比，測序芯片多樣化，可適用于不同的應用需求。童貽剛教授及其團隊在抗擊埃博拉病毒的第一線，通過半導體測序平臺所完成的埃博拉病毒深度測序的研究成果“Genetic diversity and evolutionary dynamics of Ebola virus in Sierra Leone”已于5月13日在《Nature》雜志在線發表（http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature14490.html）。

 

 

 

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