10x Genomics發布新品：首款Visium儀器CytAssist
近幾年，空間轉錄組技術發展如火如荼，由于其應用前景廣闊，已成為生命科學領域的研究熱點。作為一家飛速發展的公司，10x Genomics公司一直致力于研發新技術，不斷推出新產品，擴充產品線，其開發的Visium空間基因表達解決方案將組織學與空間分辨率的全轉錄組分析相結合，可在組織背景下對基因表達進行定位和定量。
FFPE樣本是臨床上十分常見的研究材料，可以長期保存病理樣本，由于其可以溯源如疾病診斷、預后等臨床信息，有很高的臨床科研價值，但核酸降解嚴重、存在分子交聯，使其成為珍貴但同時富有挑戰的樣本類型。為了解決FFPE樣本降解嚴重的問題，10x Genomics于2021年推出了Visium FFPE基因表達解決方案初代產品，可以對長期保存的FFPE組織樣本的全轉錄組進行分析，并具有完整的組織覆蓋度，可重新分析長期保存的生物庫樣本以發現生物標志物，或開展回顧性研究和縱向研究。
為了解鎖更多場景下的FFPE樣本，如被貼在普通玻片上的歸檔樣本、大面積的組織樣本、計劃先對樣本進行初篩選定感興趣區域后再進行后續實驗等，10x Genomics于近日發布了首款Visium儀器CytAssist，這是一款小型臺式儀器，它可以將普通玻片上FFPE組織的轉錄組分析物轉移到10x Visium基因表達玻片上，從而架起組織學與基因組學的橋梁。
FFPE樣本是臨床上十分常見的研究材料，可以長期保存病理樣本，由于其可以溯源如疾病診斷、預后等臨床信息，有很高的臨床科研價值，但核酸降解嚴重、存在分子交聯，使其成為珍貴但同時富有挑戰的樣本類型。為了解決FFPE樣本降解嚴重的問題，10x Genomics于2021年推出了Visium FFPE基因表達解決方案初代產品，可以對長期保存的FFPE組織樣本的全轉錄組進行分析，并具有完整的組織覆蓋度，可重新分析長期保存的生物庫樣本以發現生物標志物，或開展回顧性研究和縱向研究。
為了解鎖更多場景下的FFPE樣本，如被貼在普通玻片上的歸檔樣本、大面積的組織樣本、計劃先對樣本進行初篩選定感興趣區域后再進行后續實驗等，10x Genomics于近日發布了首款Visium儀器CytAssist，這是一款小型臺式儀器，它可以將普通玻片上FFPE組織的轉錄組分析物轉移到10x Visium基因表達玻片上，從而架起組織學與基因組學的橋梁。
10x Genomics提供從儀器設備、試劑耗材到分析軟件的完整解決方案。此款助力型儀器與H&E染色或免疫熒光染色（IF）的FFPE樣本兼容，配套使用的Visium玻片具有2個捕獲區域，每個捕獲區域面積為6.5mm*6.5mm或者11mm*11mm，兩款開源的用戶友好型軟件Space Ranger及Loupe Browser可進行下游數據處理分析及可視化展示。
對置于普通標準載玻片上的FFPE樣本進行脫蠟和成像處理后，進行解交聯和探針雜交，然后將兩張標準載玻片和一張含兩個捕獲區域的Visium玻片放入CytAssist儀器中，使標準玻片上的組織切片與Visium玻片上兩個捕獲區域的頂部對齊。儀器捕獲明場圖像以提供空間定位用于校準及數據分析，然后將轉錄組分析物與Visium玻片雜交，從而實現組織轉錄組分析物從普通玻片到Visium玻片的轉移，后續探針延伸及文庫構建等操作與Visium FFPE標準流程相同，在儀器外即可完成。
10x Genomics還對Visium FFPE的初代產品進行了升級，升級到v2.0版本的產品包含全新設計的玻片和試劑，可適配于Visium CytAssist儀器。
升級后的Visium FFPE v2.0產品具有以下幾個特性：
① 升級后的玻片對組織的粘附性更高，不用再做預測試即可開展正式實驗
② 采用了新的探針設計，對于約90%的基因設計了三對探針對，對于一些高表達的基因設計了一對探針，具有高靈敏度和高特異性
③ 提供商業化的35種蛋白組合試劑盒，可以對同一FFPE樣本進行轉錄組和蛋白質的同時分析，對基因表達檢測的同時檢測幾十種蛋白
④ 檢測范圍拓寬：質檢標準為DV200>30%，可檢測更多高降解度的樣本
⑤ 配置升級：新增加了大面積11mm*11mm捕獲區域，解鎖更多可能性。
① 升級后的玻片對組織的粘附性更高，不用再做預測試即可開展正式實驗
② 采用了新的探針設計，對于約90%的基因設計了三對探針對，對于一些高表達的基因設計了一對探針，具有高靈敏度和高特異性
③ 提供商業化的35種蛋白組合試劑盒，可以對同一FFPE樣本進行轉錄組和蛋白質的同時分析，對基因表達檢測的同時檢測幾十種蛋白
④ 檢測范圍拓寬：質檢標準為DV200>30%，可檢測更多高降解度的樣本
⑤ 配置升級：新增加了大面積11mm*11mm捕獲區域，解鎖更多可能性。
Visium CytAssist儀器和FFPE v2.0產品現在均已接受訂購，早下單早發貨！歡迎通過如下方式聯系我們，電話: 010-84409661，Email: marketing@emtd.com.cn。
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