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核心期刊要求提供實驗原始數(shù)據(jù)對文章投稿的影響

瀏覽次數(shù):19732 發(fā)布日期:2019-7-4  來源:本站 本站原創(chuàng),轉(zhuǎn)載請注明出處

近日,中國學(xué)者熟知的PLOS ONE和PLOS Biology在投稿指南里指出,7月1日起,要求所有作者提供WB相關(guān)的原始數(shù)據(jù),并存放在可用的數(shù)據(jù)庫中,提供可查詢的信息。

在《JBC》的作者投稿要求中也需要提供原始數(shù)據(jù)作為評審的依據(jù)。如果稿件正在審核中,未按照要求提供或拒絕提供這些數(shù)據(jù)的作者的文章將成為拒收理由。

http://www.jbc.org/site/misc/edpolicy.xhtml

在權(quán)威雜志《nature》的要求中,作者可能會被要求提交原始的,未經(jīng)處理的圖像。https://www.nature.com/nature-research/editorial-policies/image-integrity

在《cell》作者須知里面也指出需要提供原始的未裁剪的原始數(shù)據(jù),如果未按時提交,可能推遲發(fā)布或存在撤稿風險https://www.cell.com/cell/authors#dist

以上列舉了幾種期刊關(guān)于提交原始圖像的信息,因為WB由于其從原始數(shù)據(jù)到最后成文展示,本身即需要裁減排版,此過程中,造假的空間就會很大。還有很多知名期刊也有類似的要求,防止WB數(shù)據(jù)造假。

Azure凝膠成像系統(tǒng)提供給客戶最真實的原始的tiff圖片,而不是經(jīng)過軟件自行修改,編輯的看著好看的圖片,例如插值圖片,插值圖像灰度值有明顯的不連續(xù)性,圖像質(zhì)量損失較大,會產(chǎn)生明顯的馬賽克和鋸齒現(xiàn)象。自動優(yōu)化圖片,軟件類似PS的手法,在形成圖像時進行自動優(yōu)化,消除背景等方法,這樣會使圖片丟失大量信息,影響數(shù)據(jù)的真實性。

Azure公司秉承實事求是,尊重科研的態(tài)度,Azure凝膠成像系統(tǒng)提供給客戶最原始的16bit的tiff圖片,tiff是最復(fù)雜的一種位圖文件格式。tiff是基于標記的文件格式,它廣泛地應(yīng)用于對圖像質(zhì)量要求較高的圖像的存儲與轉(zhuǎn)換。由于它的結(jié)構(gòu)靈活和包容性大,它已成為圖像文件格式的一種標準。信息量大,真實反映實驗結(jié)果。

 以上和大家說了原始圖片的期刊要求,我們看看關(guān)于定量數(shù)據(jù)的要求:

 JBC期刊雜志要求使用總蛋白定量,傳統(tǒng)的單一蛋白會有潛在的不穩(wěn)定表達的風險,影響定量的準確性:http://jbcresources.asbmb.org/collecting-and-presenting-data#basics

在《Nature》和《Cell》雜志中鼓勵在一張印跡膜上進行印跡實驗,平行膠因為體系和條件的不同會影響定量的準確性,熒光方法更符合。《Cell》http://crosstalk.cell.com/blog/common-pitfalls-in-figure-preparation
化學(xué)發(fā)光方法由于其自身的半定量和一次僅能進行單一的信號采集,所以才會有這么多學(xué)術(shù)造假的文章出現(xiàn),化學(xué)發(fā)光檢測的局限性就體現(xiàn)出來了。之后科學(xué)家為了尋求解決方法,熒光western blot檢測應(yīng)運而生。
熒光Western blot使用熒光染料標記的二抗進行檢測,膜上的靶標蛋白濃度與可見熒光信號強度呈線性關(guān)系,實現(xiàn)真實可靠的定量分析。熒光染料發(fā)射光譜不同,因此在一張印跡膜上可實現(xiàn)多重檢測。在無需剝離和二孵育條件下,進行上樣量質(zhì)控,可以分析翻譯后修飾蛋白。
因此當您進行如下實驗室,選擇熒光檢測方法,妥妥的:

> 同時檢測多種蛋白

> 研究翻譯后修飾蛋白

> 同一印跡膜的上樣質(zhì)控

> 精確定量western blot實驗

綜上所述,采用現(xiàn)在動態(tài)范圍更寬的多重熒光western blot檢測方法來進行western blot檢測,實現(xiàn)真正的定量要求,無需剝離膜和二次孵育,進行上樣質(zhì)控,目標蛋白和內(nèi)參蛋白在同一張膜上,就不會發(fā)生和避免上面數(shù)據(jù)造假的情況發(fā)生,更容易被期刊雜志接收。
Azure凝膠成像系統(tǒng)秉承實事求是,尊重科研的態(tài)度,提供給客戶最真實的原始的數(shù)據(jù)。
 

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