單細胞轉錄組測序及生信分析培訓班報名通知

瀏覽次數(shù)：5897　發(fā)布日期：2019-5-23　來源：本站　本站原創(chuàng)，轉載請注明出處

單細胞測序技術近年屢次被評為生物科研熱點，文獻發(fā)表也呈現(xiàn)迅猛增長趨勢。Nature期刊最近評出2019年最值得期待的7項生物技術，擴展單細胞生物學（Expand single-cell biology）位列其中之一。SBC引進的10x Genomics Chromium™平臺，基于GemCode™微流控技術進行單個細胞分選，可一次性獲得大量單細胞的基因表達數(shù)據(jù)，從而達到在單細胞水平進行表達測序的目的。

為幫助科研工作者深入了解單細胞測序技術，SBC茲定于2019年6月28-29日在上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心舉辦單細胞轉錄組測序及生信分析培訓班。希望通過此次培訓讓學員全面了解單細胞測序技術的實驗原理、應用，并上機模擬操作Demo數(shù)據(jù)的生信分析等。誠邀報名參加，本次培訓班實行小班制（限額20人，報滿截止）。

主辦單位：上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心

培訓日期：2019年6月28日-29日
培訓地點：上海市浦東新區(qū)張江高科技園區(qū)李冰路151號1號樓

一、日程安排：

時間	主題	課程內容
6月28日	單細胞測序技術介紹	單細胞測序技術的發(fā)展及10Xgenomic單細胞測序原理介紹
	樣本準備	單細胞樣本準備及常見問題
	樣本準備	Demo實驗
	R語言基礎	R基本概念：向量、數(shù)組和矩陣、函數(shù)；R從文件讀取數(shù)據(jù)、根據(jù)需要編輯、轉換數(shù)據(jù)結構；文件圖表等的生成導出
	10X單細胞轉錄組分析流程及原理介紹	Cellranger運行環(huán)境、服務器配置，如何從fastq生成表達矩陣等系列結果；Seurat的使用、算法解析等
	10X單細胞轉錄組分析上機操作	在R交互環(huán)境運行Seurat、向量準備、畫圖函數(shù)使用、數(shù)據(jù)結構解剖處理等；R畫圖包括PCA、tSNE、VlnPlot、PCHeatmap等
6月29日	單細胞轉錄組結果報告解讀	單細胞轉錄組結果報告解讀
	10X單細胞ATAC-seq分析流程及原理介紹	cellranger-atac運行、運行過程中使用算法介紹及結果解讀
	10X單細胞ATAC-seq分析上機操作	Loupe Cell Browser軟件運行、ChIPseeker對peaks結果注釋、Cicero介紹
	單細胞高級分析	Monocle的原理算法介紹；高分文章案例數(shù)據(jù)集作圖：擬時序、譜系分析等
	單細胞測序技術的應用與實驗設計思路解析	單細胞測序技術的應用與實驗設計思路解析