轉錄組研究策略及RNA-seq數據分析6月專題培訓班通知

瀏覽次數：3538　發布日期：2014-6-5　來源：本站　本站原創，轉載請注明出處

轉錄組研究策略及RNA-seq數據分析專題強化培訓班

2014年6月15日-20日，中國·青島

轉錄組研究策略及RNA-seq數據分析專題強化培訓班將于2014年06月15日-20日在青島大學國際學術交流中心舉辦。本期培訓班以第二代測序、第三代測序（單分子測序）在轉錄組學中的應用與RNA-seq數據分析為主題，精心設計了具有前沿性、實用性和針對性強的理論課程和上機課程。理論課程由擔任國家973計劃（轉錄組方向）首席科學家、國家自然科學基金重點專項負責人于軍、胡松年等多位研究員親自授課，上機課程由實踐經驗豐富的一線科研人員帶領學員親自實踐RNA-seq數據分析流程。本班因老師時間的問題一年只舉辦一次，歡迎各領域廣大科研工作者和高校教師及研究生積極報名參加！

主辦單位

北京路思達生物信息科技有限公司

上海瑋瑜生物科技有限公司

承辦單位

上海陳珖文化傳播有限公司

培訓時間：2014年6月15日至20日（6月15日報到）

培訓地點：青島大學國際學術交流中心

課程安排

時間	課程內容	學時	講師
06月15日（周日）全天	報到、注冊
06月16日（周一） 9:00-12:00	轉錄組學發展前沿、科研思路及技術路線	3h	于軍
06月16日（周一） 13:30~16:30	動物轉錄組項目研究講解	3h	于軍
06月17日（周二） 9:00-12:00	二代測序、三代測序在轉錄組學研究中的應用	3h	胡松年
06月17日（周二） 13:30~16:30	植物轉錄組、微生物轉錄組項目研究講解	3h	胡松年
06月18日（周三） 9:00-12:00	二/三代測序儀原理介紹轉錄組建庫實驗流程詳解（包括文庫選擇，測序文庫構建注意事項）測序文庫試劑的選擇和使用心得等	3h	中科院專家
06月18日（周三） 13:30~16:30	轉錄組數據分析概述與經驗交流（1）介紹轉錄組數據分析的整體流程：包括de novo轉錄組分析、有基因組reference的轉錄組分析、microRNA分析等。（2）轉錄組分析經驗交流：包括測序量如何選擇；測序質量如何評估；如何根據自己的實際情況選擇mapping/denovo assembly軟件；如何從轉錄組數據尋找生物學問題。 Linux常用基本命令 R語言應用簡介	3h（上機）	中科院專家
06月19日（周四） 9:00-12:00	轉錄組denovo（無參考序列）測序數據拼接及分析：利用trinity實現轉錄組denovo組裝，并進行預測蛋白序列、篩選差異基因及計算表達量等功能分析的講解。	3h（上機）	中科院專家
06月19日（周四） 13:30~16:30	基于二代RNA-seq的差異基因分析（參照序列）：主要利用tophat和cufflinks,cuffdiff以及cummeRbund 等工具，實現reads的mapping, 轉錄本的重構，轉錄本的表達量計算，差異基因分析以及利用cummeRbund圖形化展示cuffdiff的分析結果。GO、KEGG富集等功能分析。	3h（上機）	中科院專家
06月20日（周五） 9:00-12:00	miRNA二代測序數據分析 1. miRNA數據mapping的原理介紹及軟件使用 2. 靶基因預測原理介紹及軟件使用 3. miRNA數據庫介紹及使用 4. miRNA的功能分析	3h(上機)	中科院專家