羅氏NimbleDesign序列捕獲定制設計軟件上線

瀏覽次數：2908　發布日期：2013-7-17　來源：本站　本站原創，轉載請注明出處

NimbleDesign是羅氏NimbleGen推出的免費在線軟件，用于NimbleGenSeqCap EZ Choice以及Choice XL人類基因組目標區域的定向捕獲探針設計。現在您只需用一分鐘注冊您的賬戶，就可以享受到NimbleGen專有的探針算法所帶來的高密度、高覆蓋、高效率的探針設計，從而開始您感興趣的目標區域定向富集，以及后續更多的二代測序應用。

從www.nimblegen.com（左圖）即可進入NimbleDesign頁面，或者直接進入design.nimblegen.com（右圖），注冊時需選擇China區域。

NimbleGenSeqCap EZ Library系列序列捕獲產品的探針設計擁有其獨特的優勢，以每次捕獲設計擁有多達200萬個探針、探針采用在目標區域的高密度疊式排布而著稱，保證了在捕獲過程中對于包括片段插入缺失等各種類型突變的有效捕獲。這些特點不僅來自于來自于探針設計時所采用的算法。NimbleGen建立了特殊的探針設計算法，使得NimbleGen的高密度探針生產工藝可以更好地應用到序列捕獲之中。而且NimbleGen優化了repeat mask算法，使得目標區域中的更多堿基序列可以直接設計探針，從而保證了目標區域的更高覆蓋。

NimbleGen自有算法可以更好的針對目標區域進行探針設計。例如上圖中對11號染色體上一個500kb的區域進行探針設計，黑色區域分別表示由兩種不同算法計算出的探針所能覆蓋的區域，而紅色區域表示只有NimbleGen的設計能覆蓋的區域。

而NimbleDesign將NimbleGen探針算法帶到您的身邊，是NimbleGenBioinformatics團隊心血之作，從此您可以全天候、全時段、零距離地使用NimbleGen專有的探針算法。下圖顯示了NimbleDesign的設計流程，提交設計背景信息、目標區域范圍以及選擇探針設計參數后，即可在最快幾分鐘到最多24小時，獲得您的探針設計文件。當您確認探針設計后，需要訂購這一產品，只需在系統中點擊Transmit，我們就會收到您的訂購需求，與您進一步聯系。

NimbleDesign軟件設計流程

● 縮短定制設計時間

● 易學易用在線軟件

● 在軟件中隨時可以獲取各種幫助信息

● 將專業的捕獲設計算法帶到您的身邊

相關公司：羅氏診斷產品（上海）有限公司
聯系電話：800-820-8864 400-820-8864
E-mail：china.lifescience@roche.com

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