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Arraystar公司lncRNA芯片最新發表文章

瀏覽次數:5439 發布日期:2011-6-16  來源:本站 本站原創,轉載請注明出處
C Braconi, et al., MicroRNA-29 can regulate expression of the long non-coding RNA gene MEG3 in hepatocellular cancer. Oncogene (2011) 1–7.

      研究者采用Arraystar lncRNA 芯片,比較HCC細胞株和良性人肝細胞的lncRNA表達水平,找到了在HCC細胞中表達顯著下調的lncRNA MEG3 (the maternally expressed gene-3),并進行了實時定量PCR的驗證。對肝癌組織和癌旁肝硬化組織的實時定量PCR實驗,以及對非腫瘤肝組織和HCC組織的ISH實驗,同樣發現MEG3在肝癌中的特異性表達下調。體外細胞實驗初步研究了MEG3的腫瘤抑制功能,包括對細胞生長和細胞凋亡的調控等。而對MEG3自身所受到的表達調控機制的研究,則提示MEG3的表達下調可能是因為MEG3啟動子發生了超甲基化,即lncRNA的表達同樣可能受到表觀遺傳調控;而MEG3啟動子的超甲基化可能是microRNA-29a 調控通路作用的結果,從而將兩類重要的非編碼RNA,microRNA和lncRNA聯系了起來。

 
 
表. 利用arraytar lncRNA芯片分析良性人肝細胞和4種不同HCC細胞株的lncRNA表達水平。表格中分別列出了與良性人肝細胞相比,在HCC中表達變化最大(下調或上調)的10條lncRNA
 
 


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