賽默飛世爾科技于國際蛋白質組學大會(HUPO)上宣布發布一個包括五個軟件解決方案的新系列,可提高定性和定量蛋白質組學工作流程
澳大利亞悉尼(2010年9月20日 ) - 全球科學服務領域的領導者賽默飛世爾科技公司,于2010年國際蛋白質組學大會(HUPO)上宣布發布一個包括五個互補性軟件解決方案的系列,致力于在定性和定量蛋白質組學應用中取得突破性進展。該軟件解決方案結合現代最新技術的Thermo Scientific質譜儀,可為研究者提供快速簡便而強大的工作流程,幫助他們應對蛋白質組學研究中不斷涌現的挑戰。這些解決方案將幫助關鍵工業創新項目取得進步,如2010年國際蛋白質組學大會(HUPO)的人類蛋白質組計劃。
“HUPO上發布的軟件創新方案加強了我們在定性和定量蛋白質組學領域中業界領先的工作流程,”賽默飛世爾科技生命科學質譜部門的蛋白質組學市場總監Andreas Huhmer說到,“這個獨特的軟件系列補充了Thermo Scientific質譜儀的功能,樣品制備和色譜技術,有助于研究者在蛋白質組學領域中獲得成功。該系列涵蓋范圍從復雜的蛋白質識別,磷蛋白質表征,蛋白質相對定量到潛在生物標志物的確認。 ”
ProteinCenter軟件將質譜數據轉換為有用的生物信息
全新Thermo Scientific ProteinCenter軟件是一個基于網絡的工具,可對蛋白質組學數據執行更快更好的積分,解析和共享。它連接著來自Thermo Scientific Proteome Discoverer軟件的以多肽為中心的信息,該軟件還具有以蛋白質為中心內容的常用生物數據庫,如UniProt和NCBI數據庫。用戶可利用這些數據庫在數分鐘內完成數據的比較和解析。 ProteinCenter TM 軟件現在包括超過1300萬個獨特的蛋白質序列,并隔周訪問,更新和整合面向公眾的蛋白質信息。
Proteome Discoverer軟件提高生產率和定量結果準確性
Thermo Scientific Proteome Discoverer軟件是一個用于蛋白質組學數據的定量和定性分析的綜合平臺。該軟件在基于工作流程的圖形用戶界面上,為大量的蛋白質組學實驗提供了一系列生物軟件工具和自定義工作流程,滿足用戶對靈活性的需求。 該軟件經過優化后可以充分利用 Thermo Scientific 質譜儀提供的高分辨率數據和多種互補性的碎裂方法。
Proteome Discoverer TM 軟件具有提高生產率和定量結果準確性的新功能。它還支持細胞培養氨基酸穩定同位素標記技術(SILAC),以加速不同處理細胞群體的蛋白質表達水平的定量分析過程。 這簡化了復雜的SILAC實驗數據的分析過程。 該軟件還可利用同量異序化學標簽(如Thermo Scientific串聯分子量標簽,TMT)以及結果的統計分析,增強了相對定量能力。多肽識別的靈活處理提高了蛋白覆蓋率,而且現在可以自動進行相對定量,數據采集以及處理。
SIEVE軟件自動對無標記數據進行差異分析
Thermo Scientific SIEVE 軟件是對無標記的蛋白質,多肽和代謝物進行半定量差異表達分析的一種自動化解決方案。使用 SIEVE TM 軟件預過濾數據可顯著減少待識別組分的數量,由此顯著增加了復雜生物標志物發現實驗的通量。
SIEVE軟件幫助可靠識別蛋白質,還可利用機器學習算法計算假陽性率。該軟件還包括一種新的統計分析能力(受試者工作特征,ROC),可識別疾病和正常蛋白之間的差異,有利于分析一個和多個潛在生物標志物的相關性。SIEVE軟件現在提供樣品濃度的歸一化處理,以自動調整差異分析結果的表達率。 與 Proteome Discover 軟件的全面整合 , 使得用戶可以將強大的蛋白質檢索識別能力應用到蛋白質差異分析結果中。
Pinpoint 軟件提高生產率和結果準確性
Thermo Scientific Pinpoint 軟件簡化了從早期生物標志物發現到 潛在 生物標志物的大規模定量 驗證 的轉變過程。它幫助研究者分析采集到的研發數據 , 利用智能 SRM(iSRM) 加速和簡化了所有實驗方法的定量分析過程。 Thermo Scientific TSQ 三重四極桿質譜儀具有iSRM功能。該功能設計用于提高目標物定量分析的靈敏度,選擇性和通量,可在一次運行中同時確認和定量數千種目標多肽。
Pinpoint TM 軟件利用保留時間模型簡化重復性實驗,最小化不同運行之間的變化,并提高結果可靠性。全新多肽篩選算法提高了多肽識別能力。
ProSightPC軟件可靠識別和表征完整蛋白質
Thermo Scientific ProSightPC 軟件利用Thermo Scientific質譜儀提供的離子對質量的高度準確性,可靠地識別和表征多肽和完整蛋白質。ProSightPC 軟件與Proteome Discover 軟件互為補充,并處理來自自上而下(top-down)或者自下而上(bottom-up)實驗的準確的MS/MS數據,包括帶有序列變異體和翻譯后修飾(PTMs)的蛋白質。重要的是,它在數據庫檢索中優先考慮生物學知識。該軟件還提供一種靈活的檢索模式,用于識別未知或未預期的修飾。ProSightPC 軟件利用高質量準確性減少了多次碎裂的復雜性,可識別一個MS/MS實驗中的多個碎片離子。
更多有關Thermo Scientific解決方案的信息,請于HUPO 2010期間訪問Thermo Scientific的展臺55,56,65和66。更多有關Thermo Scientific蛋白質組學研究解決方案的信息,請撥打+1800-532-4742,發郵件至 analyze@thermofisher.com 或者訪問 www.thermosc i en t ific. c om/ms
關于賽默飛世爾科技
賽默飛世爾科技(紐約證交所代碼: TMO )是全球科學服務領域的領導者,致力于幫助客戶使世界更健康、更清潔、更安全。公司年度營收達到 100 多億美元,擁有員工 35,000 多人服務客戶。這些客戶包括:醫藥和生物技術公司、醫院和臨床診斷實驗室、大學、科研院所和政府機構以及環境與工業過程控制裝備制造商等。公司借助 Thermo Scientific 和 Fisher Scientific 這兩大品牌,幫助客戶解決從常規測試到復雜的研發項目中所面臨的各種分析方面的挑戰。 Thermo Scientific 向客戶提供了一整套完整的高端分析儀器、實驗室設備、軟件、服務、耗材和試劑,以實現實驗室工作流程綜合解決方案。 Fisher Scientific 為衛生保健、科學研究,安全和教育領域的客戶提供完整的實驗室裝備、化學藥品、供應品和服務的組合。賽默飛世爾科技將努力為客戶提供最為便捷的采購方案,為科研的飛速發展不斷地改進工藝技術,并提升客戶價值,幫助股東提高收益,還為員工創造良好的發展空間。欲了解更多信息,請瀏覽公司網站 : www.thermofisher.com 或中文網站 www.thermo.com.cn ; www.fishersci.com.cn 。